Un modèle de dégradation en phase hétérogène Les i-carraghénases : Un modèle de dégradation en phase hétérogène Etienne Rebuffet Février 2008
Les galactanes d’algues rouges Agarose κ-carraghénane de la charge négative ι-carraghénane λ-carraghénane
Applications des carraghénanes Cosmétique Agriculture Dentifrice Stimulent les défenses des plantes Médecine Anti-coagulant Anti-viral Agroalimentaire Gélifiant Emulsifiant
La dégradation en phase hétérogène Collaboration entre différentes enzymes pour la dégradation d’un substrat récalcitrant ENDO PROCESSIVE EXO
La ι-carraghénase d’A. fortis Domaine B Domaine A Hélice β Topologie du site actif de type tunnel => Dégradation processive Michel, G. et coll. The structural bases of the processive degradation of iota-carrageenan, a main cell wall polysaccharide of red algae. Journal of molecular biology 334, 421-33 (2003).
Résultats et perspectives Boucle formée par les résidus 343 à 349. Mutants catalytiques obtenus (E245, D247, E310) ■ Biochimie ■ Cocristallisation
Zobellia galactanivorans Isolé à Roscoff depuis une algue rouge : Delesseria sanguinea Décrite par T. Barbeyron Delesseria sanguinea
Les ι-carraghénases de Z. galactanivorans Domaine B Hélice β Domaine A CgiA_Af CgiA_Zg CgiB_Zg CgiC_Zg
Les ι-carraghénases de Z. galactanivorans CgiA_Zg CgiB_Zg CgiC_Zg Synergie entre les trois enzymes ?
Stratégie ■ Surexpression et purification des ι-carraghénases de Z. galactanivorans ■ Identification des produits de dégradation de ces iotases ■ Détermination des paramètres cinétiques (kcat, Vm) ■ Structures cristallographiques
Remerciements Equipe de glycobiologie marine CZJZEK Mirjam MICHEL Gurvan BARBEYRON Tristan JAM Murielle Région Bretagne CNRS Financement ARED du projet Iotase3D