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En milieux oligotrophes les diazotrophes ont un avantage écologique La compréhension des flux de carbone, leur contrôle et leurs conséquences sur la concentration.

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Présentation au sujet: "En milieux oligotrophes les diazotrophes ont un avantage écologique La compréhension des flux de carbone, leur contrôle et leurs conséquences sur la concentration."— Transcription de la présentation:

1 En milieux oligotrophes les diazotrophes ont un avantage écologique La compréhension des flux de carbone, leur contrôle et leurs conséquences sur la concentration en CO 2 atm. ainsi que sur la productivité des zones oligotrophes côtières font partie des enjeux scientifiques majeurs à lheure actuelle. Sédiments Réseau trophique Diazotrophes nitrogénase CO 2 Piège à C 50% Production nouvelle N2N2

2 A B C Projet UNIMED : SOFCOM (A), DYFAMED (B), Gabès (C) Echantillonnages saisonniers et spaciaux – Activité diazotrophes Diversité diazotorphes – Facteurs de contrôle - Isolement A: Le Moal & Biegala (2009) B: stage Ismaïl 2011 (Biegala et al. in prep) C: Thèse Ismaïl ( )

3 Outils moléculaires fluorescents pour la détection spécifique de micro-organismes dintérêts Organisme cible Autres organismes Recherche fondamentale Projet UNIMED Identification des diazotrophes Recherche appliquée Identification de micro-organismes Pathogènes ou toxiques Isabelle BIEGALA Technique TSA-FISH (Biegala et al. 2002, 2008)

4 Environnement physico-chimique (T4, P2) T°C; PSU; NO 3 - ; NO 2 - ; NH 4 + ; PO4 - Diversité des Groupes Fonctionnels du Phytoplancton Contribution au fonctionnement du milieu marin Approches classiques automatiques (T2, P2, P1 ) Approches moléculaires non-automatiques (T1, P1, P2) HPLC; Cytométrie TSA-FISH; PCR/clonage picoeucaryotes (P2, P1) diazotrophes (P1, P2 ) Mesures des stocks (T3, P2, P1 ) Biomasse, Chl-a, CHN

5 Stage et thèse Ismaïl: prélèvement avril 2011; campagnes oceanos juin 2012 et septembre 2012

6 Projets acquis -Formation 2009 TSA-FISH LMM INSTM -Expert LMM INSTM -CPU-IRD : Gabès-PFT (voyages et séjours France/ Tunisie) -INCOMMET : Formations TSA-FISH autres INSTM/autres Tunisie/Afrique Ouest- Est -FISHBOX FUI : développement doutils moléculaires associes à une technologie innovante -Thèse co-tutelle : bourse Alternance/INSTM/UNIV-Sfax/ OT-MED en cours


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