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Thierry de Meeûs Laboratoire de recherches et de coordination sur les Trypanosomoses, UMR177 IRD/CIRAD, TA A-17/G, Campus International de Baillarguet,

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1 Thierry de Meeûs Laboratoire de recherches et de coordination sur les Trypanosomoses, UMR177 IRD/CIRAD, TA A-17/G, Campus International de Baillarguet, Montpellier Cedex 5, France. Génétique et Evolution des Maladies Infectieuses (GEMI) UMR CNRS/IRD 2724, UR IRD

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3 Méthodes indirectes Méthodes directes

4 Neutralité: une hypothèse assez forte TYPES DE MARQUEURS Enzymes mRNA +- CTCTCTCT AGAGAGAG Primer1 Primer2 PCR CTCTCTCTCT AGAGAGAGAG Primer1 Primer2 + - Microsatellites Electrophorèse AUGCAGCCAUAGGCG Phe-Pro-Leu-Ileu-Val

5 f( ) = + = p f( ) = q Proportions de Hardy-Weinberg f( ) = p² ; f( ) = 2pq ; f( ) = q²

6 Altérations des proportions de Hardy Weinberg Déficits en hétérozygotes Effet Wahlund Taenia solium Nasonia vitripenis Endogamies Rh - Rh - Rh + Rh - Sous dominance Causes techniques Allèles nuls Dominance des allèles courts Homogamie

7 Schistosoma Candida albicans Altérations des proportions de Hardy Weinberg Excès d'hétérozygotes HLA Ixodes ricinus Anémie falciforme et Plasmodium falciparum Superdominance Hétérogamie Clonalité Biais de dispersion sexe spécifique Hétérosis Trypanosoma brucei

8 Les F-Statistics de Wright F IS l F IS F ST Estimations RAPPEL: Variance: ² = [1/n]. i [(x i -x)²] ; s² = [1/(n-1)]. i [(x i -x)²] Estimateurs f et θ de Weir & Cockerham F IT H Obs =2p 1 (1-p 1 )-2p 1 (1-p 1 )F IS

9 Structure d'une Population Taille des Unités de Reproduction Migration

10 Génétique des populations d' Ixodes ricinus et borréliose de Lyme en Suisse B. burgdorferi B. valaisiana B. garinii B. afzelii B. Spielmanii

11 IR8IR25IR27IR32IR39All f ( F is estimator) Déficits en hétérozygotes

12 Distribution sexe spécifique du polymorphisme B. burgdorferi B. valaisiana B. garinii B. afzelii Biais de dispersion sexe spécifique des tiques

13 Détection des Borrelia dans les tiques Pour Borrelia burgdorferi P= FM Sex of the tick Prévalence of B. burgdorferi ss

14 Pour Borrelia afzelii SainesInfectées Détection des borrélies dans les tiques SainesInfectées

15 Vers adultes (couple) dans la veine mésenthérique. La femelle est contenue dans le canal gynécophore du mâle Œuf évacué avec les selles de lhôte définitif Eclosion dune larve aquatique: miracidium Reproduction sexuée Biomphalaria glabrata mollusque deau douce hôte intermédiaire Emission massive de cercaires clonales Reproduction asexuée Rattus rattus (rat noir) infecté lors dun "bain" Zone de transmission Site de transmission (arrière mangrove) Région détude Schistosoma mansoni et ses hôtes (rat et mollusque) en Guadeloupe

16 Les F-Statistics de Wright et Clones F is l F is F st F it

17 Génétique des populations des diploïdes clonaux ou partiellement clonaux F is 0 Loci C=[ ], Nm not small F is 0 Loci C=1, Nm small F ST ~0.5 F is 0 Loci C=[ ], Nm small F st >>0.5 F is 0 Loci C=1, Nm not small F st <<0.5

18 Clones structurés en nombreux dèmes F st =-F is /(1-F is ); F it =0

19 Candida albicans à Abidjan (Côte dIvoire) 42 Patients AIDS 19 patientes 23 patients J0 Traitement anti-fungique J15 Rechute de 13 patients F Patient 0.5 (P<0.001) F Sex 0.08 (P<0.02) F D0-D (P<0.001) 14 loci enzymatiques F is =-0.66 F is =-0.97

20 Structuration de Candida albicans chez des patients HIV + de Côte d'Ivoire


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