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Unveiling fungal zooflagellates as members of freshwater picoeukaryotes: evidence from a molecular diversity study in a deep meromictic lake Lefèvre et.

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1 Unveiling fungal zooflagellates as members of freshwater picoeukaryotes: evidence from a molecular diversity study in a deep meromictic lake Lefèvre et al., 2007

2 Etude de la biodiversité de picoeucaryotes basée sur des méthodes moléculaires au Lac Pavin Exposé présenté par: HAMOUDA Amine Lojou Vincent Etudiants en Master I – COM U33: Diversité des Organismes Marins

3 Lac Pavin Géographiquement :

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5  Il est né d'une explosion volcanique qui creusa le flanc du puy de Montchal.  De forme presque circulaire, surface de 44ha, profondeur max est de 92m, enchâssé dans une forêt, et influence anthropique relativement faible. Lac Pavin

6 Procédé expérimental  Filtration: On n’a gardé que les organismes de taille <5µm  L’échantillonnage à des profondeurs variables: 5m (épilimnion) 9-10m (métalimnion) m (oxycline) 30 m (hypolimnion)

7 Procédé expérimental  Extraction d’ADN + Amplification par PCR Construction de l’arbre phylogénique  Détection des ADNr 18S  Détermination des affiliations phylogéniques, calcul des distances et alignement par des méthodes Bioinformatiques.

8 Profil vertical de température, d'oxygène et de Chlorphylle a mesurés le au Lac Pavin Profil vertical de température, d'oxygène et de Chlorophylle a mesurés le au Lac Pavin T(°C), O2 (mg l –1 ) Chl a (μg l –1 )

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10 Arbre Phylogénétique  Nouveau clade 1: Asteronella formosa un Diatomée parasité par un Rhizophydium

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12  Nouveau clade 4 est frère des Euglypha rotunda Euglypha spEuglypha rotunda

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14  Nouveau clade 5 fait parti des Perkinsea, ici une espèce qui parasite un bivalve: philippinarum

15 Courbes de raréfaction  Sont obtenus par extrapolation des valeurs d’OTU en fonction du nombre de clones, via des outils informatiques.  Le palier est synonymes de biodiversité maximale atteinte.

16 Zone oxique Zone oxique du Zone oxycline Zone oxycline Courbes de raréfaction Nombre de clones % OTU

17 Courbes de raréfaction  Biodiversité maximale atteinte: : en oxycline (50-60 m) : en zone oxique( 0-60 m)

18 Abondance relative Abondance en % Zone oxique Oxycline

19 Abondance relative Abondance en % Zone oxique Oxycline

20 Conclusion  La communauté du lac Pavin est unique: Meromictie Biodiversité découverte avec 5 nouveaux clades  Le parasitisme est important dans la communauté des picoeucaryotes, et influence sur les producteurs primaires.

21 Conclusion  Diversité très variable en fonction de la saison.  2 écosystèmes dans le lac Pavin: Oxycline La zone oxique  Les populations sont différentes en comparaison avec d’autres études sur des lacs.

22  Une grande diversité des picoeucaryotes est à découvrir. Conclusion

23 Critiques  Les valeurs de Bootstrap sont parfois illisibles, ceci ne nous permet pas de discuter la solidité de l’arbre.

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26 Critiques  Certains graphiques sont difficilement lisibles.

27  La méthode est basée uniquement sur les phylogénies moléculaires  Utilisation d’autres marqueurs moléculaires pour renforcer la phylogénie.  L’écosystème des nouveaux clades découverts? Critiques

28 FIN

29 Bibliographie     Olive P., BoulègueJ. ;étude biogéochimique d'un lac méromictique :le lac Pavin, France;Géomorphologie : relief, processus, environnement, 2004, n° 4, p  


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