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CBGP Thématiques de recherche : Caractérisation de la biodiversité. Biologie des bio-agresseurs et de leurs antagonistes. Origine, évolution et conséquences.

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1 CBGP Thématiques de recherche : Caractérisation de la biodiversité. Biologie des bio-agresseurs et de leurs antagonistes. Origine, évolution et conséquences des invasions biologiques. Caractérisation des réservoirs des maladies émergentes. Compréhension des règles d’assemblage des communautés. ► Taxonomie systématique et phylogénie ► Génétique des populations et phylogéographie ► Biologie de l’adaptation : génétique, génomique et traits d’histoire de vie ► Écologie des populations et des communautés Groupes de réflexion

2 Projets génomique/transcriptomique Projets obtenus ou prévus en 2014 : 12 pour du séquençage de génomes, 13 pour du transcriptome, 4 pour des profils d’expression, 17 pour du génotypage par séquençage, 14 pour des amplicons, 8 pour de la capture 5 pour des séquençages de grands fragments.

3 Bioinformatique Développement de logiciels – Génétique des populations – Analyse bioinformatique Analyse de séquences _ génomique _transcriptomique Infrastructure informatique Calcul : Cluster de 400 cœurs Stockage : 40 To

4 Transcriptomique Comparaison de deux populations de la processionnaire du pin (Thaumetopoea Pityocampa). Bernhard Gschloessl a,*, Heiko Vogel b, Christian Burban c, David Heckel b, Réjane Streiff a, Carole Kerdelhué

5 transcriptomique Modèles Pyrale Processionnaire du pain Données Illumina : Outils d’assemblage Oases Trinity


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