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Les -carraghénases : Un modèle de dégradation en phase hétérogène Etienne RebuffetFévrier 2008.

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1 Les -carraghénases : Un modèle de dégradation en phase hétérogène Etienne RebuffetFévrier 2008

2 Les galactanes dalgues rouges Agarose κ-carraghénane ι-carraghénane λ-carraghénane de la charge négative

3 Applications des carraghénanes Médecine Anti-coagulant Anti-viral Cosmétique Agriculture Agroalimentaire GélifiantEmulsifiant Stimulent les défenses des plantes Dentifrice

4 La dégradation en phase hétérogène Collaboration entre différentes enzymes pour la dégradation dun substrat récalcitrant ENDO EXO PROCESSIVE

5 La ι-carraghénase dA. fortis Michel, G. et coll. The structural bases of the processive degradation of iota-carrageenan, a main cell wall polysaccharide of red algae. Journal of molecular biology 334, (2003). Domaine B Domaine A Hélice β Topologie du site actif de type tunnel => Dégradation processive

6 Résultats et perspectives Boucle formée par les résidus 343 à 349. Mutants catalytiques obtenus (E245, D247, E310) Biochimie Cocristallisation

7 Zobellia galactanivorans Delesseria sanguinea Isolé à Roscoff depuis une algue rouge : Delesseria sanguinea Décrite par T. Barbeyron

8 CgiA_Af CgiA_Zg CgiB_Zg CgiC_Zg Les ι-carraghénases de Z. galactanivorans Domaine B Domaine A Hélice β

9 Les ι-carraghénases de Z. galactanivorans CgiA_Zg CgiB_Zg CgiC_Zg Synergie entre les trois enzymes ?

10 Stratégie Surexpression et purification des ι-carraghénases de Z. galactanivorans Identification des produits de dégradation de ces iotases Détermination des paramètres cinétiques (kcat, Vm) Structures cristallographiques

11 Remerciements Equipe de glycobiologie marine CZJZEK Mirjam MICHEL Gurvan BARBEYRON Tristan JAM Murielle Région Bretagne CNRS Financement ARED du projet Iotase3D


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