Un modèle de dégradation en phase hétérogène

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1 Un modèle de dégradation en phase hétérogène
Les i-carraghénases : Un modèle de dégradation en phase hétérogène Etienne Rebuffet Février 2008

2 Les galactanes d’algues rouges
Agarose κ-carraghénane de la charge négative ι-carraghénane λ-carraghénane

3 Applications des carraghénanes
Cosmétique Agriculture Dentifrice Stimulent les défenses des plantes Médecine Anti-coagulant Anti-viral Agroalimentaire Gélifiant Emulsifiant

4 La dégradation en phase hétérogène
Collaboration entre différentes enzymes pour la dégradation d’un substrat récalcitrant ENDO PROCESSIVE EXO

5 La ι-carraghénase d’A. fortis
Domaine B Domaine A Hélice β Topologie du site actif de type tunnel => Dégradation processive Michel, G. et coll. The structural bases of the processive degradation of iota-carrageenan, a main cell wall polysaccharide of red algae. Journal of molecular biology 334, (2003).

6 Résultats et perspectives
Boucle formée par les résidus 343 à 349. Mutants catalytiques obtenus (E245, D247, E310) ■ Biochimie ■ Cocristallisation

7 Zobellia galactanivorans
Isolé à Roscoff depuis une algue rouge : Delesseria sanguinea Décrite par T. Barbeyron Delesseria sanguinea

8 Les ι-carraghénases de Z. galactanivorans
Domaine B Hélice β Domaine A CgiA_Af CgiA_Zg CgiB_Zg CgiC_Zg

9 Les ι-carraghénases de Z. galactanivorans
CgiA_Zg CgiB_Zg CgiC_Zg Synergie entre les trois enzymes ?

10 Stratégie ■ Surexpression et purification des ι-carraghénases de Z. galactanivorans ■ Identification des produits de dégradation de ces iotases ■ Détermination des paramètres cinétiques (kcat, Vm) ■ Structures cristallographiques

11 Remerciements Equipe de glycobiologie marine CZJZEK Mirjam
MICHEL Gurvan BARBEYRON Tristan JAM Murielle Région Bretagne CNRS Financement ARED du projet Iotase3D