La présentation est en train de télécharger. S'il vous plaît, attendez

La présentation est en train de télécharger. S'il vous plaît, attendez

La traduction chez les procaryotes: régulation au niveau de linitiation.

Présentations similaires


Présentation au sujet: "La traduction chez les procaryotes: régulation au niveau de linitiation."— Transcription de la présentation:

1 La traduction chez les procaryotes: régulation au niveau de linitiation

2 Initiation de la synthèse protéique: Rappels Intermédiaire clé = complexe dinitiation 30S 70S Seule étape « covalente » Etape importante: sélection du mRNA

3 Interaction 30Sc/SD -Exp protection RNAses 30-40nt du mRNA/ ribosome -Quand AUG connus20nt AUG 13nt -1974: Shine et Dalgarno sur 6 séquences connues 3 mRNA GGAGG AUG 5 rRNA 16S 3 CCUCC 5 -Ensuite nombreuses expériences: 3 rRNA 16S très conservées et accessibles Oligos comp du 3 rRNA inhibent traduction In vivo ribosomes avec 3rRNA*: Protéines produites si SD*

4 Eléments essentiels pour linitiation 3 mRNA GGAGG AUG 5 rRNA 16S 3 CCUCC 5 5nt (3-9nt) 3-12nt -Espacement SD/AUG pas précis. Mais si 14nt:Initiation facteur 10 mini -Codon start: AUG, GUG, UUG pas AUU sauf infC (IF3) chez E. coli: 83%, 14%, 3% -Composition SD Rétrocontrôle <0 -Autres: A ou U préférence entre SD/AUG Structure IIaire mRNA: accessibilité SD et AUG

5 mRNA sans SD (Moll et al, Mol Microbiol vol 43 pp ) NNNAUG NNN= quelques nt voire 0 -Ce type de mRNA existe dans tous les règnes du vivant Peut affecter efficacité trad: structure IIaire? - CI mRNA=leaderless 70S (/30s) utilisé pour complexe initiation in vitro. Pas pour AUG avec SD Mais in vitro…. -Autre hyp: fonctionne comme trad euc: 30S-IF2-tRNA fmet Initiation sans contact rRNA-mRNA CI mRNA Traduit in vitro avec lysat réticulocytes

6 40S Processus dinitiation chez les pro et eucaryotes (Moll et al, Mol Microbiol vol 43 pp )

7 -Contrainte pour mRNA sans leader: 5AUG GUG ou UUG: perte complète ou quasi de traduction -Cest AUG et pas appariement codon/anticodon=important CI-lacZ fusion traductionnelle/AUGCodon ambre (UAG) Phénotype?? +tRNA initiateur suppresseur ambre Phénotype?? -Un grand nombre de génomes bactériens séquencés35 à 40 mRNA sans leader identifiés Peu fréquents chez G- ( CI; tetR de Tn Caulobacter crescentus et 1 thermus thermophilus) + fréquents chez G+/ Steptocoques et lactocoques Communs chez les archae ( Sulfolobus solfataricus: 144 gènes analysés/ monocistroniques ou 5proximaux dun opéron = sans leader) 8 dans la mitochondrie humaine Hyp= mRNAs sans leader ressembleraient aux mRNAs?????

8 comme senseurs de lenvironnement (0 transacting élément) -Partenaires:. protéines: rôle le + souvent <0. RNA: nombreux exps. mRNA Régulation Cible principale: linitiation -Initiation= étape limitante du processus

9 Romby et Springer 2003 Trends in Genetics vol 19 pp Compétition directe: mécanisme le plus simple

10 mRNA senseur de T° Exp: rpoH codant heat shock Romby et Springer 2003 Trends in Genetics vol 19 pp

11 Les riboswitches dans le contrôle de linitiation traduction -Terme nouveau introduit par équipe Breaker Winkler et Breaker 2005 Ann Rev Microbiol vol:59 pp Domaine structuré dans région non codante de mRNA agissant en cis -Fixe métabolite et contrôle expression de gènes en lien avec métabolite -Contrôle transcription, traduction et même épissage chez euc. Molécule cible Seq et structure conservées Structure générale + variable, conversion evt de fixation en conséquence sur expression (modif structure IIaire)

12 Winkler et Breaker 2005 Ann Rev Microbiol vol:59 pp

13 Mime de fonction Iaire pour fonction de régulation Cas de ThrRS=thréonyl-tRNA synthase: le mieux étudié Romby et Springer 2003 Trends in Genetics vol 19 pp

14 Opérateur thrS tRNA thr

15 Opérateur thrS tRNA thr ss RNA D1 et D3 ds RNA D2 et D4 Si CGUCAU (anticodon tRNA met ) opérateur Perte reg par ThrRS; contrôle par Met tRNA synthase Romby et Springer 2003 Trends in Genetics vol 19 pp

16 ThrRS -Homodimère -3 domaines : N ter Catalytique Cter Forme ailée Aminoacylation Reconnaissance boucle anticodon Core Régulation: ThrRS/1 opérateurD2 et D4 même position que tRNA Acylation: ThrRS/2tRNA Boucle anticodon/Cter Bras accepteur séquestré entre Cat et Nter

17 ThrRS Nter+2tRNA thr (gris) ou +2D2 (rouge) Romby et Springer 2003 Trends in Genetics vol 19 pp

18 ThrRS Nter+2tRNA thr (gris) ou +2D2 (rouge) Romby et Springer 2003 Trends in Genetics vol 19 pp Reconnaissance: même spécificité Cter/anticodon ou D2 -D2 fixée à ThrRS même conformation que tRNAImmitation; mime « Mimicry » aa de D2 reconnaissance de ThrRS=aa de D4Hyp: D2 et D4 reconnaissance= Quelle différence permet discriminer les deux fonctions de ThrRS?

19 -La différence principale entre opérateur et tRNA= bras accepteur Romby et Springer 2003 Trends in Genetics vol 19 pp Mutation aa dans bras 0 effet sur contrôle -boucle interne dans D2, pas dans tRNA: mutation ponctuelle Altération du contrôle et reconnaissance parThrRS

20 Mécanisme de la répression par ThrRS ThrRS ribosome Compétition: Encombrement stérique d de 9 nt entre D1 et D2 Perte du contrôle Nter ThrRS Perte du contrôle in vivo (fixation OK in vitro) N ter responsable de lencombrement stérique ThrRS/ribosome Modèle: avec tRNA thr ??

21 ThrRS = régulateur Compétition avec ribosome Traduction thrS ThrRS = enzyme Forte tRNA thr Faible tRNA thr


Télécharger ppt "La traduction chez les procaryotes: régulation au niveau de linitiation."

Présentations similaires


Annonces Google