Réunion ModStatSAP 12 mars 2019 IMOTEP Informations, MOdèles et Traitement des données en Epidémiologie et dynamique des Populations Etat des lieux, projets Thierry Hoch, Hervé Richard

Centre Automatisé de Traitement de l’Information : Un CATI, qu’est-ce que c’est? Centre Automatisé de Traitement de l’Information : Entité pour répondre à la condition réglementaire pour perception de la prime informatique par les personnels de BAP E (Informatique, Statistiques et Calcul scientifique) Modalité d’organisation en collectif pour la production informatique et/ou de services en soutien à la production scientifique sur une thématique donnée ou de l’appui à la recherche Collectif permettant l’intégration de compétences informatiques multiples pour conduire l’intégralité du processus (« de la donnée brute à la valorisation ») dans une stratégie « gagnant-gagnant » entre les unités, les départements et l’Inra.

Réunion ModStatSAP 12 mars 2019 Genèse du projet Mission du CATI IMOTEP : Organiser et de développer des projets d’ingénierie en lien avec les recherches dans les domaines de l’épidémiologie (animale et végétale), et de la dynamique des populations dans les paysages agricoles En lien avec les réseaux : ModStatSAP, Payote,… 1/ S’appuyer sur les projets existants 2/ Développer des interactions Réunion ModStatSAP 12 mars 2019

© M. Chelle

Réunion ModStatSAP 12 mars 2019 IMOTEP couvre l’ensemble de la chaîne de traitement des données : Acquisition et gestion des données, notamment en lien avec la mise en place des Plates-Formes d’Epidémio-Surveillance. Développement outils d’acquisition d’information Traitement des données : statistiques, analyse de données –omiques, data mining Modélisation dynamique (EDO, EDP) Développement d’outils de simulation Réunion ModStatSAP 12 mars 2019

Réunion ModStatSAP 12 mars 2019 Au 1er mars, IMOTEP rassemble : - 33 agents ITA - issus de trois départements (MIA, SA et SPE) - appartenant à 12 unités (BioSP, EpiA, BIOEPAR,…) Réunion ModStatSAP 12 mars 2019

Réunion ModStatSAP 12 mars 2019 En lien avec ModStatSAP : Idée de monter des ateliers « pratiques » autour d’outils Quand ? 1 journée à l’automne 2019 Quel sujet ? - Outils de calcul et de développement : * Conteneurisation (Singularity) * Jupyter * Parallélisation - Outils développés par des agents du CATI À discuter Réunion ModStatSAP 12 mars 2019