Boudouma Nedjma et Hoarau Ludovic

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1 Boudouma Nedjma et Hoarau Ludovic
Deep questions in the tree of life. (Keeling, 2007) Genomic minimalism in the early diverging intestinal parasite Giardia lamblia. (Morrison et al., 2007) Boudouma Nedjma et Hoarau Ludovic

2 Giardia lamblia Le protiste parasite le plus répandu aux Etats-Unis
Les trophozoïtes flagellés infestent l' intestin grêle. - Cycle parasitaire de Giardia lamblia - (D'après Meyer et Jaroll, 1980)

3 TAXONS PEU ROBUSTES Génome totalement décrypté. Giardia lamblia parmi
Ouverture du débat sur l'origine des eucaryotes TAXONS PEU ROBUSTES Giardia lamblia parmi les DIPLOMONADINES

4 Caryomastigonte: unité de base
2 noyaux diploïdes Flagelles (undulipodiums) Caractère dérivé propre : Caryomastigonte: unité de base Caractères particuliers : 2 noyaux diploïdes identiques Absence de mitochondries et de peroxysomes

5 Découverte du mitosome : relique mitochondriale ?
Cette espèce amitochondriale comporte des génes qui sont clairement dérivés d'une mitochondrie ex : cnp60 et DnaK Découverte du mitosome : relique mitochondriale ? Tachezy, (2001) Remise en cause de leur position à la « racine eucaryote » avant l'endosymbiose mitochondriale. Endosymbiose mitochondriale (ά-proteobactérie ) chez les Diplomonadines plus ancienne que la divergence de toutes les lignées d' Eucaryotes A.J. Roger et al. (1998)

6 Caractères dérivés résultant d'un mode de vie parasitaire ? ou
De nombreux gènes eucaryotes sont absents (genomic minimalism). Des enzymes clés du métabolisme sont absentes. Machines protéiques plus simples que les autres Eucaryotes. Tendance à la simplification des mécanismes moléculaires, structure du cytosquelette et voies métaboliques par rapport aux autres lignées Eucaryotes Caractères dérivés résultant d'un mode de vie parasitaire ? ou Caractères ancestraux dans l'évolution des Eucaryotes ?

7 Divergence de Giardia dans l'analyse
Plantae Straménopiles Alvéolés Fungi Unichontes Discicristates Escavates Divergence de Giardia dans l'analyse phylogénétique des protéines ribosomiales. Divergence profonde de Giardia et de Trichomonas (Escavates) dans l'arbre des Eucaryotes = 2Ga

8 De nombreux HGT (Horizontal Gene Transfert) ≈ 10 gènes concernés
HGT d'origine bactérienne (cnp60, DnaK ) HGT d'origine : Bactérie gram + (NADPH) HGT d'origine Archées (ORFs) Rôle important dans la construction du génome et des processus métaboliques Giardia lamblia

9 D'après Keeling (2005) Existence de ces 5 groupes actuellement contestée

10 Références Andersson J. et al., Phylogenetic analyses of diplomonad genes reveal frequent lateral gene transfers affecting eukaryotes. Curr Biol; 13(2):94-10. Keeling P.J., The tree of eukaryotes. Trends in Ecology & Evolution. 20, 670. Lecointre G. et Le Guyader H., Classification phylogénétique du vivant. Belin Ed. 560 p. Roger A. J. et al., A mitochondrial-like chaperonin 60 gene in Giardia lamblia: evidence that diplomonads once harbored an endosymbiont related to the progenitor of mitochondria. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:229–234. Tachezy J., Sánchez L.C., Müller M., Mitochondrial type iron-sulfur cluster assembly in the amitochondriate eukaryotes Trichomonas vaginalis and Giardia intestinalisindicated by the phylogeny of IscS, a key protein of this process. Mol. Biol. Evol. 18: