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Représentation du Thésaurus MeSH et de la Terminologie CISMeF en OWL Lina Soualmia Laboratoire PSI – CNRS 2645 – INSA & Université de Rouen Equipe CISMeF.

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1 Représentation du Thésaurus MeSH et de la Terminologie CISMeF en OWL Lina Soualmia Laboratoire PSI – CNRS 2645 – INSA & Université de Rouen Equipe CISMeF CHU de Rouen & L@STICS

2 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 20042 Plan Introduction CISMeF Prototype KnowQuE Choix de modélisation en OWL Travaux en cours

3 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 20043 Introduction http://www.chu-rouen.fr/cismef/ 13 227 ressources Utilisation de standards pour la modélisation : Métadonnées : ajoutent de la sémantique aux données. Terminologie structurée: même rôle quune ontologie de domaine. Améliorer la recherche dinformation

4 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 20044 La Terminologie CISMeF Mots Clés (22 012) et Qualificatifs (84) du MeSH hépatite, diabète.. diagnostic, complications, prévention et contrôle.. hépatite/diagnostic Métatermes (104) : Spécialités médicales ou Sciences biologiques Cardiologie, Pédiatrie… Liens sémantiques avec les Mots Clés/Qualifs, Type de ressource. Types de ressources (144): Renseignent la nature de la ressource Cours, base de données, information patient...

5 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 20045

6 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 20046KnowQuE Knowledge-based Query Expansion System [AIME03; FQAS 04; IPMU 04] Base Morphologique Flexions : {Cœur, Cœurs}, Dérivations : { Cœur, Cardiaque} Base de Règles dAssociation hépatite B / prévention et contrôle vaccin anti-hépatite B Terminologie CISMeF en OWL-DL

7 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 20047

8 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 20048 Choix de Modélisation Passage base de données à une Ontologie Formelle en OWL-DL Représentation des concepts et relations : connaissances taxinomiques Intérêt: mécanismes de raisonnement puissants consistance classification automatique Structure de lontologie Concepts : Métatermes,Mots clés et Types de Ressources. Relations : Qualificatifs; domaine restreint par des contraintes. Les ressources sont des instances de concepts.

9 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 20049 Traduction Automatique Java/SQL Top-Down Distinction des relations Is-a et Part-Of (anatomie et régions géographiques) Désaccentuation Caractères illégaux (-, : ) et espaces Noms préfixés par un nombre 11-hydroxycorticostéroïdes _11_hydroxycorticosteroides

10 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 200410 Concepts (Classes)

11 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 200411 Rôles (Relations)

12 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 200412 Domaines ….

13 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 200413 Ressources

14 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 200414 Fichier OWL résultat 23 420 concepts 9 861 Mots clés 104 Spécialités 144 Types de Ressources 13 227 Ressources 85 rôles 84 Qualificatifs 1 relation PartOf 25 MB Import sous Protégé Réduction à 3000 Ressources Import : 30 minutes

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16 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 200416

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18 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 200418 Vérification de la Consistance ~ 4 heures Prétraitement des fichiers MeSH : BD structurée Distinction des notions Utilisation de lopérateur dintersection Ressources et Domaines ont des descriptions Indexation des Ressources manuelle

19 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 200419

20 lina.soualmia@chu-rouen.fr Journée Web Sémantique Médical - Rouen - Mars 200420 Travaux en cours Arborescence anatomie prendre en compte les cas particuliers: [A11 ] Cellules, [A12] Liquides et sécrétions biologiques, [A15] Systèmes sanguins et immunitaires: cellule sanguine est une cellule Améliorer les descriptions Utiliser UMLS les relations du réseau sémantique : is_treated_by; is_complicated_by Projet ATONANT À partir des note scope


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