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- Rubrique 3 - PLANS DORGANISATION DU VIVANT ET PHYLOGENIE Programme de lagrégation SV-STU Sciences de la Vie 3.1 Les méthodes actuelles de la systématique.

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1 - Rubrique 3 - PLANS DORGANISATION DU VIVANT ET PHYLOGENIE Programme de lagrégation SV-STU Sciences de la Vie 3.1 Les méthodes actuelles de la systématique

2 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.1- Les méthodes actuelles de la systématique Groupes monophylétiques, paraphylétiques, polyphylétiques Daprès Lecointre&Leguyader, 2006

3 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.1- Les méthodes actuelles de la systématique Méthode cladistique = chercher les parentés par distinction des caractères dérivés 1.Echantillonnage taxonomique 2.Choix des caractères informatifs 3.Construction de la matrice des caractères. Homologies primaires. Polarisation des caractères 4. Construction des arbres possibles 5. Choix dun arbre par la méthode de parcimonie Daprès Lecointre&Leguyader, 2006

4 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.1- Les méthodes actuelles de la systématique Méthode de parcimonie Daprès Lecointre&Leguyader, 2006

5 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.1- Les méthodes actuelles de la systématique Méthode phénétique et UPGMA Daprès Lecointre&Leguyader, 2006

6 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.1- Les méthodes actuelles de la systématique Méthodes de parcimonie Daprès Lecointre&Leguyader, 2006 & inrp.fr Crâne de Cératosaure (Jurassique) n : narine fa : fenêtre antéorbitaire or : orbite fti : fenêtre temporale inférieure fm : fenêtre mandibulaire Autres caractères à utiliser :. Membrane nictitante. Gésier

7 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.3- Plan dorganisation des Métazoaires La classification des Métazoaires

8 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.3- Plan dorganisation des Métazoaires La classification des Métazoaires

9 - Rubrique 3 - PLANS DORGANISATION DU VIVANT ET PHYLOGENIE Programme de lagrégation SV-STU Sciences de la Vie 3.2 La phylogénie du vivant

10 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.2- La phylogénie du vivant Les trois « règnes » du vivant Paroi cellulaire de peptidoglycanes avec acide muramique ARNt initiateur portant N-formylméthionine Lipides membranaires avec liaison éther Il existe bicouches formée de tétraéthers ADN dans un noyau (délimité par enveloppe) Microtubules, polymères de tubuline Flagelle avec structure 9+2 Mitochondries ADN divisé en chromosomes pouvant être compactés Division cellulaire par mitose (intervention MT) Daprès Lecointre&Leguyader, 2006

11 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.2- La phylogénie du vivant Larbre des eucaryotes Eucaryotes Bicontes Unicontes Daprès Lecointre&Leguyader, 2006 Lignée verte Chromoalvéolés Rhodobiontes Chlorobiontes Alvéolobiontes Algues rouges Algues vertes Embryophytes Ciliés Dinophytes Apicomplexés Algues brunes Eugléne / Trypanosome Euglénobiontes Foraminifères Straménopiles Eumycètes Rhizopodes Métazoaires Animaux Champignons Amibes Opisthocontes

12 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.2- La phylogénie du vivant Larbre des eucaryotes Daprès Lecointre&Leguyader, 2006 GroupeSynapomorphies UnicontesCellules libres avec un flagelle BicontesCellules libres avec deux flagelles Lignée verteChlorophylle a, les deux s.u de la Rubisco sont codées par lADN chloroplastique ChromoalvéolésChloroplaste entouré de 4 membranes OpisthocontesChitine, flagelle propulseur RhodobiontesPerte des centrioles, mitose fermée, phycobilisome ChlorobiontesChlorophylle a, b, c ; réserve damidon intrachloroplastique AlvéolobiontesNombreuses vésicules aplaties (alvéoles) sous la membrane plasmique StraménopilesFlagelles hétérocontes (dont un avec mastigonème) ForaminifèresFilopodes, test glycoprotéique (éventuellement calcifié secondairement) EuglénobiontesMicrotubules corticaux, crêtes mitochondriales discoïdes MétazoairesMEC contenant du collagène, structure du spermatozoïde Eumycètes18s, EF, HSP RhizopodesPseudopodes, caractères moléculaires

13 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.2- La phylogénie du vivant Larbre des eucaryotes Daprès Lecointre&Leguyader, 2006 / Raven, 2000 ESPECE Nom latin ESPECE Nom français CARACTERES Plasmopora viticolaMildiou de la vigne Flagelles hétérocontes, paroi cellulosique Puccinia graminisRouille du bléFormation de basidiospores, paroi contenant de la chitine, mycélium à cloison perforée. Coprinus picaceusCoprin cheveluFormation de basidiospores, paroi contenant de la chitine, mycélium à cloison perforée Fucus vesiculosusFucus vesiculeuxChloroplaste entouré de 4 membranes, flagelles hétérocontes, paroi cellulosique Ulva sp.Laitue de merChlorophylle a & b, 0 à 2 flagelles lisses

14 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.2- La phylogénie du vivant Lorigine endosymbiotique … : les arguments Daprès Selosse&Loiseaux, La Recherche n°296

15 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.2- La phylogénie du vivant Lorigine endosymbiotique … : lendosymbiose primaire Daprès Selosse&Loiseaux, La Recherche n°296

16 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.2- La phylogénie du vivant Lorigine endosymbiotique … : lendosymbiose secondaire Daprès Selosse&Loiseaux, La Recherche n°296

17 - Rubrique 3 - PLANS DORGANISATION DU VIVANT ET PHYLOGENIE Programme de lagrégation SV-STU Sciences de la Vie 3.3 Plan dorganisation des Métazoaires

18 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.3- Plan dorganisation des Métazoaires Principaux plans dorganisation EspècesGroupeSymétrie / PolaritésSynapomorphies du groupe Éponge SpongiairesAsymétrique ou axiale ou centrale / Polarité variable (monophylie incertaine) choanocytes Hydre CnidairesAxiale / polariséDeux feuillets épithéliaux, une cavité gastrique, cnidocytes, larve planula Planaire PlathelminthesBilatérale / polarisation antéro-postérieure Bilatériens avec tube digestif a un seul orifice Ascaris NématodesBilatérale / polarisation antéro-postérieure Sz sans acrosome, organes sensoriels particuliers amphides et sensilles Néréis AnnélidesBilatérale / polarisation antéro-postérieure Vers métamérisés, syst.circulatoire clos, métanéphridies Écrevisse Crustacés/DécapodesBilatérale / polarisation antéro-postérieure A1 biramées / Scaphognathites (exopodite Mx2), pinces sur les premières paires de pattes locomotrices Criquet InsectesBilatérale / polarisation antéro-postérieure 3 paires de pattes, une paire dantennes uniramées

19 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.3- Plan dorganisation des Métazoaires Principaux plans dorganisation EspècesGroupeSymétrie / PolaritésSynapomorphies Moule Mollusques/LamellibranchesBilatérale / polarisation antéro-postérieureManteau et cavité palléale, squelette calcaire, pied musculeux, radula/ coquille à deux valves, perte de la radula Escargot Mollusques/GastéropodesBilatérale / polarisation antéro-postérieureManteau et cavité palléale, squelette calcaire, pied musculeux, radula/ torsion de la masse viscérale à 180°, tentacules céphaliques Oursin ÉchinodermesBilatérale / polarisation antéro-postérieureSN diffus situé en position superficielle Truite Vertébrés/TéléostéensBilatérale / polarisation antéro-postérieureVertèbres/symétrie apparente de la nageoire caudale Grenouille Vertébrés/BatraciensBilatérale / polarisation antéro-postérieureVertèbres/il existe un pigment vert dans les bâtonnets de la rétine Poulet Vertébrés/OiseauxBilatérale / polarisation antéro-postérieureVertèbres/Plume de type rémige, fourchette Souris Vertébrés/MammifèresBilatérale / polarisation antéro-postérieureVertèbres/Poils, glande mammaire

20 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.3- Plan dorganisation des Métazoaires La classification des Métazoaires Daprès Lecointre&Leguyader, 2006

21 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.3- Plan dorganisation des Métazoaires Validité du critère morphologique Daprès Ridley, 1997

22 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.3- Plan dorganisation des Métazoaires Convergence évolutive Téléostéen Dauphin Daprès Ridley, 1997 / Beaumont & Cassier 1983

23 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.3- Plan dorganisation des Métazoaires Convergence évolutive Daprès Eckert, 1999

24 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.3- Plan dorganisation des Métazoaires Convergence évolutive Daprès Ridley, 1997

25 - Rubrique 3 - PLANS DORGANISATION DU VIVANT ET PHYLOGENIE Programme de lagrégation SV-STU Sciences de la Vie 3.4 La lignée verte et son adaptation aux différents milieux de vie

26 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.4- La « lignée verte » et son adaptation aux différents milieux de vie Classification des Embryophytes Daprès Raven, 2000

27 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.4- La « lignée verte » et son adaptation aux différents milieux de vie Classification des Embryophytes Daprès Raven, 2000

28 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.4- La « lignée verte » et son adaptation aux différents milieux de vie Classification des Embryophytes Daprès Lecointre&Leguyader, 2006

29 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.4- La « lignée verte » et son adaptation aux différents milieux de vie Adaptations végétatives : poïkilohydrie, structures de soutien et de conduction Daprès Raven, 2000

30 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.4- La « lignée verte » et son adaptation aux différents milieux de vie Adaptations végétatives : poïkilohydrie, structures de soutien et de conduction Daprès Raven, 2000

31 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.4- La « lignée verte » et son adaptation aux différents milieux de vie Symbioses (mycorhizes, nodosités) Daprès Sélosse, 2001

32 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.4- La « lignée verte » et son adaptation aux différents milieux de vie Symbioses (mycorhizes, nodosités) Daprès Sélosse, 2001

33 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.4- La « lignée verte » et son adaptation aux différents milieux de vie Symbioses (mycorhizes, nodosités) Daprès Sélosse, 2001

34 3- Plans dorganisation du vivant et phylogénie 3.4- La « lignée verte » et son adaptation aux différents milieux de vie Symbioses (mycorhizes, nodosités) Daprès Sélosse, 2001


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