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Doctorante: Kieu Oanh NGUYEN Directeur de Thèse: Pr. Dr. Eric GONTIER Co-directeur de Thèse: Dr. Rebecca DAUWE Equipe de recherche « Procédés pour la production.

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1 Doctorante: Kieu Oanh NGUYEN Directeur de Thèse: Pr. Dr. Eric GONTIER Co-directeur de Thèse: Dr. Rebecca DAUWE Equipe de recherche « Procédés pour la production de biomolécules » BioPI EA3900- Biologie des Plantes et Innovation UPJV, Faculté des Sciences, 33 rue Saint Leu, Amiens, France BioPI EA3900- Biologie des Plantes et Innovation UPJV, Faculté des Sciences, 33 rue Saint Leu, Amiens, France Date de début de Thèse: Mai 2010 Date de soutenance prévue: Mai 2013

2 Isatis tinctoria L., Brassicaceae Indirubine Agrobacterium rhizogenes Tuyau d’arrivée d’air Solution nutritive GC-MS et LC-MS  La métabolomique: une vision globale des métabolites présents dans la plante…  Analyse du métabolome: révéler des changements métaboliques globaux après l’application d’un traitement

3  Etude de la bibliographie (base en place, maintien à jour et approfondissement)  Analyses GC-MS et LC-MS sur des extraits de graines et de fruits d’Isatis tinctoria pour caractériser la valeur potentielle des huiles dans les graines.  Même démarche suivie pour les feuilles et les racines de la plante: caractériser « tous » les métabolites présents dans chaque partie de la plante (.  Cultures hydroponiques mises en place pour étudier l’influence de souches bactériennes (Agrobacterium rhizogenes ) sur:  la croissance de plantes // augmentation de la vitesse de croissance, plus de biomasse produite par unité de temps.  la biosynthèse des métabolites secondaires et primaires // approche métabolomique utilisant XC-MS sous la langue R. Etat d’avancement

4 XC-MS profiling Extraction des méabolites (et dérivatisation). Chromatographie (GC, LC) couplée à la spectrométrie de masse (MS). Intégration des pics (caractérisés par un temps de rétention RT et un m/z). Analyses statistiques par XC-MS sous la langue R. Identification des pics: AMDIS (Automated Mass spectral Deconvolution and Identification System) + NIST (libraires: Golm, BioPI – 56 métabolites) Par GC-MS, 132 métabolites ont été étiquetés dans les feuilles et les racines d’Isatis tinctoria L.: Etiquetés par groupe : 81 Acide aminés : 23 Sucres : 16 (not identified) Acides organiques : 16 Glucosinolates : 12 (not identified) Autres : 14 Autres composés étiquetés non identifiés : 51

5 Pour la suite:  Continuer à compléter nos résultats de GC-MS et LC-MS.  Réaliser des cultures hydroponiques stériles pour l’étude de l’interaction plante-microorganismes.  Tests d’activité anti-microbien de l’extrait de feuilles et de racines d’Isatis tinctoria. Difficultés rencontrées  Le manque de standards spécifiques engendre une difficulté pour l’identification des molécules. Résultats attendus  Evaluation du potentiel d’ Isatis tinctoria pour la production de métabolistes d’intérêt pharmaceutique à partir de cultures hors-sol.  Des publications sur les travaux de thèse.


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