Inventaire et délimitation taxonomique et systématique des Genista

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1 Inventaire et délimitation taxonomique et systématique des Genista
en coussinets épineux de France méditerranéenne. Aïda GASMI Codirection : Errol VELA & Thierry TATONI MedBiodiv Tlemcen, 11 octobre 2010

2 Introduction Inventaire Dénombrer et identifier Organismes vivants Taxonomie et systématique Description Classification

3 Introduction Outils d’identification et limites liées à leur utilisation : Flores locales ou pays limitrophes Outils moléculaires et BD associées: séquences ADN, Genbank, BOLD project. Outils valables pour taxons connus, mais problématiques dans le cas de nouvelles espèces ou des complexes taxonomiques.

4 Formes littorales : ex: Astragalus tragacantha
Introduction Parmi la végétation caractérisant le bassin Méditerranéen se trouvent les plantes épineuses et à port en coussinet. Formes littorales : ex: Astragalus tragacantha sophy.u-3mrs.fr Formes de montagne: landes hérissons à genêts épineux + Astragales en montagne.

5 Intérêt du genre Genista
Introduction Intérêt du genre Genista -Taxon principalement méditerranéen, il porte en lui une partie de l’histoire récente environnementale du bassin. -Taxon ayant une certaine propension à l’endémisme à aire restreinte. -Taxon occupant des milieux ouverts caractéristiques de la végétation méditerranéenne. Sujet aux phénomènes de polyploïdie et d’hybridation (rôle dans la spéciation). Pourquoii ce groupe?

6 Introduction: modèle d’étude
Les landes-hérissons à genêts épineux sur les crêtes ventées de Provence calcaire: G.lobelii, près du littoral. Epineux, port en coussinet. Endémique de Provence Sect.Erinacoides. G.pulchella s.l., basses montagnes de l’arrière pays provençal, +/- épineux, port prostré. Sect.Spartioides

7 Introduction: modèle d’étude
Distribution de G.lobelii et G.pulchella s.l en Provence. G.lobelii G.pulchella s.l Marseille

8 Introduction: modèle d’ étude
Flores de France (Fournier 1934) : G. villarsii Flora europea (1968): G.pulchella = G.villarsii G.pulchella Vis. subsp. pulchella Kerguelen(1993) Genista pulchella s.l. G.pulchella Vis. subsp. villarsii

9 D’après Seinderbinder-Rondon 1989
Introduction: Contexte et problématique Genista pulchella s.l , Sect.Spartioides. Carte conception taxonomique actuelle (Conti 2008). G.pulchella subsp villarsiana G.pumila subsp eliassenneni G.pulchella subsp pulchella G.pulchella subsp aquilana D’après Seinderbinder-Rondon 1989

10 Méthodologie + Résultats
Première étape Phylogénie globale du genre Genista afin de placer les taxons et de vérifier la concordance des sections avec flores en vigueur. Travaux réalisés sur section ou région donnée Originalité Af du N

11 1ère partie: Phylogénie du genre Genista
-Nombre de taxons pris en compte : 98 20 taxons nouvellement séquencés (dont 15 inédits) + 78 taxons Genbank : total 390 séquences. -Marqueurs génétiques: 1 nucléaire (ITS1-5.8S-ITS2) + 2 chloroplastiques (trnLF, trnK-matK). Nettoyage et alignement des séquences (MEGA4). Concaténation des marqueurs nucléaires et chloroplastiques  maximiser le résolution. Phylogénie Globale du genre Genista  placer les taxons d’un point de vue de la parenté + insights evolutifs Analyse phylogénétique retenue: maximum parcimonie (Paup 4.0).

12 1ère partie: Phylogénie du genre Genista
Arbre phylogenetique, maximum parsimony, bootstrap =1000

13 Résultats: Phylogénie du genre Genista
Positionnement des taxons de la section Erinacoides Insertion de taxons de la sect.Spartioides dans la section Erinacoides : G.benehoavensis, G.albida, G.obtusiramea,G.pulchella s.l. Geliassennesii

14 Méthodologie + Résultats
Seconde étape Etude morphométrique des populations de Genista lobelii et Genista pulchella s.l. en Provence.

15 2e partie: Morphométrie genêts de Provence
Carte des populations considérées avec hypothèse taxonomique a priori. N G.villarsiana G.sp G. "pulchella"  auct. Globel ok Gpulchella Pop problématique G.lobelii

16 80 individus mesurés et 2771 mesures efféctuées.
2e partie: Morphométrie genêts de Provence individus par site numérotés et étiquetés. 3 réplicats par organe Basé sur les travaux de Conti 2008 Hauteur Long min Long max L jeune rameau L feuille l feuille L épine Gousse l Aile L Aile l Carène L carène l Etendard L Etendard l Gousse L Nbr de côtes 8 variables morphometriques mesurés 16 mesures 80 individus mesurés et 2771 mesures efféctuées.

17 2e partie : Morphométrie genêts de Provence
2 types d’analyses: -Analyses par populations  calcul de la médiane, centiles, minima et maxima (restitué sous forme de boxplot). -Analyses par individus  analyses multivariées (ACP) et classification ascendante hiérarchique.

18 Résultats: Morphométrie Genêts de Provence
2e partie : Morphométrie genêts de Provence Analyses par populations 5 critères discriminant G. lobelii de G. pulchella s.l. Résultats: Morphométrie Genêts de Provence StV Vtx C R

19 ACP sur 80 individus (Individus regroupés par site)
2e partie : Morphométrie genêts de Provence Analyses par individus : forte variabilité intra population ACP sur 80 individus (Individus regroupés par site)

20 Discussion: Phylogénie du genre Genista
Pas de résolution nette des marqueurs nucléaires et chloroplastiques. Niveau taxonomique faible dans tout l’agrégat « lobelii / pulchella s.l ». proximité génétique avérée du Genêt supposé hybride. Existence d’un complexe d’espèces (sous-espèces, variétés?)

21 Discussion: Morphométrie genêts de Provence
G.villarsiana G. "pulchella"  auct. G.lobelii G.sp Hypothèse taxonomique a priori

22 Discussion: Morphométrie genêts de Provence
Révision de l’hypothèse taxonomique a posteriori N G. lobelii subsp. villarsiana G. lobelii subsp. lobelii Hybrides et/ou Intermédiaires² Globel ok Gpulchella Pop problématique

23 Perspectives: Recours à la caryologie
Synthèse travaux antérieurs: Seinderbinder-Rondon (1989) G.lobelii subsp.lobelii : 2n=18. G.lobelii subsp.villarsiana : majorité 2n=18 (+ quelques 2n=36 en zone de contact). Populations présumés « hybrides » (Rians) ou « intermédiaires » (Mourottes) : non comptées à ce jour…

24 MERCI POUR VOTRE ATTENTION