BIO 4518: Biostatistiques appliquées Le 20 septembre 2005 Laboratoire 1 Introduction à S-PLUS.

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1 BIO 4518: Biostatistiques appliquées Le 20 septembre 2005 Laboratoire 1 Introduction à S-PLUS

2 Bonjour à tous Caroline Mimeault carolinemimeault@hotmail.com Bureau: D’Iorio (DRO) 221 Tel: 562-5800 xt. 6009 Heures de bureau: Sur rendez-vous, quand vous voulez, sauf le lundi

3 S-PLUS Pour ouvrir S-PLUS: –START/Programs/SPLUS Les données sont sur: –http://simulium.bio.uottawa.ca/bio4118

4 Au début de chaque session de S-PLUS Vous devez TOUJOURS changer le fichier dans lequel vous travaillez pour les objets S-PLUS afin de les sauvegarder dans le bon répertoire et non sur le disque dur C Commencez en ouvrant Object Explorer en cliquant sur le bouton

5 Pour changer de répertoire (1) Avec le bouton droit de la souris, cliquez sur Search Path Sélectionez Attach/Create Chapter

6 Pour changer de répertoire (2) Cliquez sur Browse pour choisir votre propre répertoire (H:/…) Changez la position de 2 à 1 afin que tous les objets soient dirigés dans votre propre répertoire

7 Attention!! Ne faites pas confiance aux feuilles de données qui apparaissent dans le répertoire par défaut de S- PLUS (C:\Insightful\..) Il est probable que ces feuilles aient été modifiées par un autre utilisateur et vous ne pourrez pas identifier les modifications Allez plutôt chercher les données dans le fichier original et sauvegardez-les sur votre H:\

8 Et pour finir… Vous pourrez vous procurer le logiciel S-PLUS Prenez la bonne habitude de vous faire des cahiers de bord: cela vous sauvera bien des soucis!!! Et, si le coeur vous en dit, contribuez à l’amélioration du manuel de laboratoire en notant les corrections dans le manuel dit CORRIGÉ

9 Prenez des pauses! Soyez à l’aise de prendre des pauses quand vous voulez pendant les laboratoires http://www.brousse-en-folie.com/broussefolie/bonus/fond3.php

10 Diapos additionnelles

11 Exercice p.134 Pour faire le graphique avec un sous- ensemble: Dans: Line/Scatter Plot [1], Data to Plot, Subset rows with: Inscrire: SURV==1 & HRS !=“NA” Les espaces sont importants!

12 Exercice p.136 Coverage (avec SURV 1 et 2) –ifelse(SURV==1, HRS*3*0.5, ifelse(SURV==2, HRS*3, "NA")) Coverage (avec SURV 1, 2 et 3) –ifelse(SURV==1, HRS*3*0.5, ifelse(SURV==2, HRS*3, ifelse(SURV==3, HRS*3*1.5, "NA")))