Initiation à la microbiologie Le projet Génome à l’école 2012-2013 Initiation à la microbiologie
Nous avons reçu une souche: Pectobacterium atrosepticum. Nous cherchons à savoir si la souche que nous avons reçu est bien Pectobacterium atrosepticum. Pour cela nous avons fait une orientation et une identification bactérienne.
Orientation Bactérienne Nous réalisons un gram. Résultat : Coccobacille, Gram-
On réalise un test d’oxydase qui est oxydase - . Nous avons effectué un état frais qui a montré que les bactéries sont mobiles. On a ensemencé un milieux Hugh et Leifson qui a démontré que la bactérie fermente le glucose en anaérobiose. On a ensuite ensemencé un milieu viande foie qui donne un type respiratoire aérobie anaérobie facultatif. Viande foie Hugh et Leifson
Orientation : famille des entérobactéries
Identification bactérienne On ensemence une galerie API 20 E (E pour Entérobactérie), à l’aide d’une suspension bactérienne réalisée à partir d’une colonie isolée, Après incubation les résultats sont les suivants: aractère ONPG ADH LDC ODC CIT H2S URE TDA IND VP GEL GLU MAN INO SOR RhA SAC 91MEL AMY ARA Lecture de la galerie + - Erwinia spp selon API 13 3 1 5 88 17 97 77 26 91 19 42 41 On remarque que les résultats expérimentaux sont en accord avec les pourcentages de réaction positives mentionnés dans le tableau d’identification proposé par biomérieux .En effet Pectobactérium atrosepticum appartient à l’ancien genre Erwinia.
Après lecture de la galerie API, on a confirmé que la souche reçue est bien Pectobacterium atrosepticum.
Par ailleurs, après ensemencement sur pomme de terre nous avons bien vu que la souche cause une maladie chez la pomme de terre.
Nous disposons donc bien au laboratoire d’une souche de Pectobacterium atrosepticum.