Post-doc, Laboratoire Epigenomics

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1 Post-doc, Laboratoire Epigenomics
Transposons à ADN et gènes domestiqués Ludivine SINZELLE Post-doc, Laboratoire Epigenomics Génopole, Evry

2 Parcours DEA :Université TOURS, Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte (1 an) Dévelopement de vecteurs de transfert de gènes basés sur le transposon mariner MosI (C. Augé-Gouillou, Y. Bigot) Doctorat :Université Paris XI, Orsay, Transgenèse et Génétique des Amphibiens (4 ans) Caractérisation des transposons Tc1-mariner chez le xénope et utilisation du transposon Sleeping Beauty en transgenèse germinale (A. Mazabraud) Post-Doctorat 1 : Max Delbrück Center, Berlin, Transposition group, Z. Ivics (3 ans) mécanisme de transposition des transposons à ADN PIF/Harbinger  Etude de la fonction des protéines domestiquées HARBI1 et NAIF1 chez les vertébrés  l’encadrement de C. Augé-Gouillou et Y Bigot. Mon sujet c’était développer des vecteurs de transfert de gènes en utilisant un transposon à ADN qui s’appelle Mos1. Je pense que l’on vous en reapelera plus tard. Je n’ai pas obtenu de bourse à Tours et j’ai pu décrocher un financement à Paris XI. J’ai travaillé sur la caractérisation des transposons Tc1-mariner dans le génome de xénope et en parallèle utilisation du transposon Sleeping Beauty en transgenèse germinale toujours chez le xénope. Ensuite j’ai eu la chance de joindre le laboratoire transposition de Z. ivics à Berlin pour 3 ans. La-bas, j’ai étudié le mécanisme de transposition d’une famille d’éléments que l’on appelle PIF-Harbinger. J’ai également étudier 2 proteines domestiquée HARBI1 et NAIF1 chez les vertébrés. Je vous parlerai plus tard de ces 2 protéines. Maintenant je suis à Evry pour un deuxième post-doc. Je travaille sur la mise au point d’une technique de transgenèse par production de spermatozöides génétiquement modifiés. Et je continue à travailler sur ces 2 protéines Post-Doctorat 2 :Université Evry, Epigenomics, N. Pollet Transgenèse par production de spermatozoïdes génétiquement modifiés chez le xénope Etude de la fonction des protéines domestiquées HARBI1 et NAIF1 chez le xénope

3 Plan I. Transposons à ADN
Classification des ETS Structure, mécanisme de transposition, classification propre Etude des transposons à ADN??? II. Gènes dérivés de transposons ou transposons domestiqués - Définition et caractéristiques - Diversité structurale - Diversité évolutive Diversité fonctionnelle  exemples Concernant le plan que je vais suivre: j’ai découpé mon exposé en 3 parties: Premièrement, Je vais vous décrire les transposons à ADN, leur positionnement dans la classification des ETS, structure, mécanisme de transposition et leur classification propre. Ensuite, je vais vous expliquer pourquoi étudier les transposons à ADN. La deuxième partie sera dédié aux gènes dérivés de transposons que l’on appelle encore transposons domestiqués (définition et caractéristiques de ces gènes. Je développerai différents exemples pour illustrer la diversité de ces gènes d’un point de vue structurale, dans les scénarios évolutifs qui leur a donné naissance et fonctionnelle Je terminerai par vous décrire mon projet de post-doc qui a consisté à l’étude de 2 protéines domestiquées NAIF1 et HARBI1. II. Exemple de protéines domestiquées SETMAR NAIF1/HARBI1

4 Eléments transposables (ETs)
Définition: Séquences d’ADN répétées qui ont la capacité de se déplacer (=transposer) d’un locus à un autre au sein d’un génome « Parasite moléculaire ou génétique » « ADN égoïste » Chez l’hôte - Les ETs sont des séquences d’ADN moyennement à hautement répétées dans les génomes et ayant la capacité de se déplacer d’un locus à un autre (transposer) au sein d’un génome. Pour la terminologie, On les qualifie aussi de parasites moléculaires ou parasites génétiques ou ADNs égoïstes. - Ces segments d’ADN n’ont pas de capacité infectieuse comme les virus c a d qu’ils n’ont pas la capacité d’infecter une cellule à partir d’une autre cellule. - Toujours pour la terminologie, on parle d’un höte pour définir l’organisme, la cellule ou le génome qui héberge tel ou tel éléments transposables. - Ces ETsn’ont pas de roles propres si ce n’est assurer leur survie dans leur organisme höte sans causer de dommages irréversibles Pas de rôle biologique

5 Classification des ETs
- 2 classes selon le mécanisme de transposition (Finnegan, 1989) Classe I ou rétrotransposon Transposition copier-coller RT ARN ADN intégrase ARN pol ADN génomique ET Il existe 2 classes d’ETs définis par le mécanisme de transposition (mobilité) :classe I ou retransposons et classe II ou transposon. -Les éléments de classe I utilisent un intermédiaire ARN dont la mobilité est sous la dépendance de trois enzymes. L’élément est copié sous forme ARN simple brin par une ARN polymerase de l’hôte, puis retro-transcrit par une reverse transcriptase et intégré dans un nouveau site par une intégrase. - Les éléments de classe II ou transposons sont excisés de l’ADN donneur et puis réintégré dans un autre site. Une seule enzyme catalyse l’excision et la réintégration la transposase. pour les retrotranspon, on parle de transposition de type copier-coller puisqu’il y a une augmentation du nombre de copies de l’élément. Pour les transposon à ADN, il s’agit d’un mécanisme de couper-coller puisque le nombre de copies reste constant. Retrotransposons autonomes: à LTR, sans LTR (LINES) Retrotransposons non autonomes: SINES ADN transposase transposase Classe II ou transposon à ADN Transposition couper-coller

6 Classification des transposons à ADN
(Wicker et al., 2007) classe II (transposons à ADN) Sous-classe 1 Sous-classe 2 Ordre ITR Ordre Crypton Ordre Helitron Ordre Maverick Crypton Hélitron Maverick Superfamilles La classification a été récemment remaniée par Wicker et al en 2007 suite à al découverte de nouveaux transposons. La classe II des transposons à ADN a été subdivisée en deux sous-classes selon les spécificités du mécanisme de transposition. Ensuite chaque sous-classe est divisé en ordre. Moi je vais vous parler exclusivement de l’ordre ITR, divisé en 9 superfamilles puis en familles, sous-familles et lignées. Familles sous-familles lignées

7 Structure générale des transposons à ADN
-Sous-classe I, ordre ITR ITR=Inverted Terminal Repeat 2500 bp Transposase gene 50 bp intron 5’UTR 3’UTR Transposase Nterm- -Cterm Comment sont constitués ces transposons à ADN? Il existe deux sous-classes. mais Je vais vous décrire uniquement les éléments de la sous classe 1 car la sous classe contient des éléments atypiques qui sont différents d’un point de vue structurale et mécanistique. Cette classification a été proposée et adoptée récemment Cette sous-classe La structure générale des transposons est la suivante: un cadre de lecture avec ou sans intron codant une transposase. Cette ORF est encadré par des UTRs (untranslated terminal regions (régions régulatrices) de taille variable) en 5’ et en 3’. Le tout est flanqué de part et d’autres séquences répétées inverséés symbolisées par les flêches bleues. La transposase codé par le gène contient en générale trois domaines fonctionnels - un domaine de fixation à l’ADN qui va reconnaître spécifiquement des séquences des ITRs ou subterminales des ITRS. Ce domaine de peut contenir différents motifs structuraux Zinc finger HTH suivant la superfamille Un signal de localisation nucléaire qui va adresser la protéine dans le noyau ou la transposition a lieu. Un domaine catalytique qui assure les réactions catalytiques de clivage de l’ADN et de ligation. Ce domaine est caractérisé par une triade catalytique DDE ou DDD Acide aspartique et glutamique. DBD=DNA binding domain - ZnF - HTH Fixation spécifique des ITRS NLS Domaine catalytique -DDE/D triade catalytique

8 Signature moléculaire
Mécanisme de transposition de type « cut-and-paste » ADN donneur TA AT TA AT TSD TSD Transposon Tc1-mariner   TA AT TA AT Intégration Excision TAXX AT AT XXTA - La transposase va médier le mécanisme de transposition. On part d’un ADN donneur (un site génomique) qui contient un transposon. Cet élément est flanqué par un dinucléotide TA. J’ai pris l’exemple d’un transposon de la superfamille Tc1-mariner caracterisé par un TA. On appelle ces dinucleotides TSD target site duplication et vous aller comprendre pourquoi. - Après avoir été synthétisé, des molécules de transposase se fixe de manière spécifique sur des sites de reconnaissance porté par chacun des deux ITRs. Ces molécules de transposase s’oligomérisent, ce qui va avoir pour conséquence de rapprocher des extrémités du transposon. La transposase produit ensuite des cassures double brin de part et d’autre de l’élément ce qui aboutit à l’excision de l’élément du site donneur sous forme d’un complexe ADN-protéine. - La transposase reconnaît ensuite un dinucléotide TA (spécifique des transposons TC1-mariner )au niveau d’un ADN cible et réintègre l’élément avec duplication du TA de part et d’autre de l’élément. Au site d’excision la coupure se produit de manière décalée de deux à trois nucléotides à l’intérieur de l’élément et cette cassure sera réparé par les . - Ce mécanisme est caractérisé par deux signatures moléculaires: la duplication du TA au site d’intégration et une cicatrice d’excision au niveau du site donneur. ADN cible TAXXAT ATXXTA TA AT Réparation de l’ADN par l’hôte TA AT TA AT Signature moléculaire transposition Duplication TSD Cicatrice d’excision

9 9 Superfamilles de transposons à ADN eucaryotes
Similitude de séquence des transposases Caractéristiques structurales Longueur et séquence ITRs/TSDs Nature des domaines fonctionnels  DBD (motif HTH ou ZnF)  Domaine catalytique Comme je vous l’ai dit, il existe a ce jour, 9 superfamilles de transposons à ADN eucaryotes basées sur les similitudes de séquence des transposases mais aussi sur les caractéristiques strusturales: longueur et séquence des ITRs très variable d’une superfamille à l’autre et aussi la longueur et la nature des TSDs.Pour Tc1-mariner, c’est le dinucléotides TA. Pour la superfamille piggybac, c’est le trinucléotide TTAA ECT. Ensuite les transposases contiennent différent motif de fixation à l’ADN HTH ou Zn et diiférente triade catalityque. Pour 2 superfamilles,le transposon en plus de coder une transposase code une deuxième protéine indispensable pour médier la transposition. Présence d’une 2 ORFs pour 2 superfamilles: CACTA et PIF/Harbinger

10 Eléments autonomes et non-autonomes
Eléments non-autonomes - Eléments actifs - MITEs =Miniature Inverted-repeat Transposable Elements Cis Trans - Pour chacune de ces différentes superfamilles, on définit des éléments autonomes et non-autonomes. - Les éléments autonomes possèdent tous les composants protéiques ou ADN pour permettre leur mobilité alors que les éléments non-autonomes n’ont aucune capacité codante. Parmi les éléments autonomes, on distingue les éléments actifs qui codent une enzyme active et les éléments défectifs par mutations ou délétions. Les éléments non-autonomes sont aussi appelés MITES et sont de très petites taille de 50 à 500 pb. Les éléments actifs peuvent peuvent mobiliser en trans les éléments - Eléments défectifs Mutations Délétions

11 transposons à ADN actifs
Naturels Synthétiques Elément P (Drosophile) Tc1 (C. elegans) Impala, Fot1 (F. oxysoparum) Sleeping beauty (poisson salmonidé) PiggyBac (insecte) Himar1 (H. irritans) Frog Prince (R. pipiens) Harbinger3_DR (D. rerio) Il existe un grand nombre de transposons à ADN mais très peu sont actifs. Je vous donne ici une liste non exhaustive de transposons actifs naturellement. Il existe aussi des transposons à ADN synthétiques qui ont été reconstruit par ingenierie moléculaire à partir de copies d’éléments défectifs. Parmi les plus populaires et en dernier Harbinger3_Dr celui que j’ai reconstruit chez le poisson. Ces différents éléments sont utilisés comme vecteurs de tranfert de gènes. De nombreux labos travaillent sur des versions hyperactives des ces éléments. Vecteurs de tranfert de gènes + versions hyperactives

12 Pourquoi étudier les TEs?
Abondance ETs représentent 45% du genome humain !!! Hua-van et al, 2005 Répartition Alors pourquoi étudier les transposons. Ce sont des constituants majeurs des génomes. Les ETs occupent une part importante des génomes. Chez la levure 3%, le nématode 6.5%, la souris 38%. Dans notre génome, ces éléments constituent 45% de l’ADN génomique. Presque la moitié de notre génome est constitué d’éléments dont on ignore le role biologique. Concernant la répartition rétrotransposon-transposon (classe I,Classe II), elle est variable d’un organisme à l’autre. - Chez l’homme, 3% des ETs correspondent à des transposons à ADN (classe II) La tendance est inversée chez C. elegans avec une vaste majorité de rétrotransposons Certains génomes sont exempts de transposons à ADN comme Saccaromyces Cerevisiae et d’autres de retrotransposons comme trichomonas vaginalis. Feschotte and Pritham, 2007

13 Pourquoi étudier les ETSs?
Impact sur l’évolution et la fonction des gènes et génomes Conséquences néfastes Effets bénéfiques - expression des gènes - mutations : duplications, insertions, deletions Maladie génétique « domestication moléculaire »= Création de nouveaux gènes Biologie propre des transposons Mécanisme de transposition, interaction avec des protéines de l’hôte, évolution, régulation de la transposition par l’hôte Mise au point de vecteurs pour la thérapie-génie ou pour la mutagenèse insertionnelle Sleeping Beauty (SB) Frog Prince (FP), PiggyBac (PB), Transposase Gène d’intéret ITR ITR Plasmide

14 II. Transposons domestiqués
Maintenant,on va passer aux transposons domestiqués

15 « Domestication moléculaire »
Domestication moléculaire (= gène domestiqué=gène co-opté=néogène) processus évolutive qui conduit un ET à devenir un composant fonctionnel, stable du génome associé à une fonction biologique (Miller et al., 1992) Critères Transposase gene phylogénétiquement lié à la transposase existe en copie unique conservé au cours de l’évolution absence ITRs et TSDs assume un rôle biologique important XX millions d’années La domestication moléculaire (on parle de gène domestiqué, gène co-opté ou neogène) est les processusn évolutif qui conduit un ET à devenir un gène donc un composant stable du genome associé à une fonction biologique importante. Les critères pour reconnaître ces gènes: ils sont phylogénétique lié à la tarnsposase dont ils dérivent. Ils existent en copie unique contrairement aux transposons qui sont des éléments répétés parfois à plusieurs 10 de milliers de copies. La domestication moléculaire n’est pas un evènement rare puisque chez l’homme, on connaît à ce jour 47 gènes qui dérivent d’ETs Gène hôte Chez l’homme, 47 gènes dérivés d’ETs (+ de 38 copies différentes)

16 Exemples transposons à ADN domestiqués
- Vous avez ici un tableau citant quelques gènes domestiqués issu d’une revue sur les ETs de 2006. -Ces gènes peuvent dérivés de n’importe qu’elle superfamille de transposon à ADN et concernent tout type d’organimes (plantes,vertébrés). - ce qu’il y a d’interessant dans ce tableau, c’est que pour la majorité de ces protéines, on ne connait pas la fonction Volff, 2006

17 Diversité structurale
Ces protéines domestiquées sont variable structuralement

18 Diversité structurale
Domestication du gène complet transposase RAG1->Recombinaison V(D)J Protéine chimérique: fusion entre gène complet transposase et domaine non apparenté Transposase ancestrale DBD Catalytic domain  SETMAR DNA repair Protéine chimérique: fusion entre DBD transposase et domaine non apparenté Il existe au moins 3 cathégories de domestication -soit domestication du gène complet de la transposase avec conservation du site de fixation à l’ADN et du domaine catalitytique. Cest le cas d’une protéine Recombinaison VDJ: RAG1=systeme immunitaire vertébré chez lymphocytes reaction recombinaison site-spécifique qui permet la production des immunoglobulines et des recepteurs de surface des Cellules T. soit creation de protéine chimérique qui est une fusion entre le gène complet de la transposase et un domaine non apparenté. C’est le cas de la protéine SETMAR impliqué dans les mécanismes de réparation ADN Soit creation de protéine de protéine chimérique fusion entre le DBD à l’ADN d’une transposase et un domaine non apparenté. C’est la cathégorie de domestication la plus répandue. Les transposons ont fourni un grand nombre et une grande diversité de motif de fixation à l’ADN. DBD Motif Zn finger - THAP (P) BED domain (hAT) WRKY/GCM1 (mutator) Motif HTH - Paired domain (Tc1) - Pipsqueak domain (Pogo) - Myb/SANT/trihelix domain (PIF/Harbinger)

19 Diversité évolutive Il existe aussi une grande diversité au point de vue des scénarios évolutifs.

20 Diversité dans les scénarios évolutifs
1. Domestication récurrente de l’élément P P Obscura chez la Drosophile G-type ou A-type (D. guanche, D. madeirensis, D. subobscura) P Montium chez la Drosophile P-tsa, P-boc (D. tsacasi, D. bocqueti) P neogenes chez Mammals/amniotes THAP9/Phsa 2. Domestication convergente de la transposase Pogo Mammifères Levure Transposase Pogo 1 Transposase Pogo 2 Domestication récurrente pour l’élément P: une ême famille de transposase Pancestral adonnénaissance à plusieurs évènements de domesticationL’élément P a donné naissance indépendamment à différents néogènes dans différentes lignées de Drosophile et également chez les mammifères. Ensuite la domestication convergente dans le cas des transposases Pogo. Deux sources de transposases de type pogo ont donné naissance indépendamment à la protéine CENP-B présente chez les mammifères et aux protéines Cbh1, Cbh2 et Abp1 chez la levure. Ces différentes protéines domestiquées indépendamment sont impliqué dans le même processus biologique: la ségrégation des chromosomes et la formation de l’hétérochromatine centromérique. Domestication CENP-B Cbh2 Abp1 Cbh1 Ségrégation chromosomes Formation hétérochromatine centromérique Casola et al., 2008

21 Diversité dans les scénarios évolutifs
3. Co-domestication PIF/Harbinger - Vertébrés Transposase Myb-like gene Transposon Harbinger ORF1 ORF2 Domestication Harbi1 Naif1 Sinzelle et al., 2008 - Drosophile Ensuite le troisième scenario évolutif concerne les transposons PIF-Harbinger. Ces transposons à ADN sont particuliers car il code une transposase mais également une deuxième protéine de type myb-like ou Madf-like dont on ignore le role mais qui est essentiel à la transposition. La co-domestication c’est que les deux protéines du transposons on été domestiqués. Il y a 2 exemples connus à ce jour. Chez les vertébrés avec un transposon Harbinger qui à donné naisssance aux protéines HARBI1 qui dérivent de la transposase et la protéine NAIF1 qui dérivent d’une proteine mib-like. Chez la Drososphile, un transposon PIF a donné naissance à la protéine DPLG7 et la protéine MADF-like à laprotéine DPM7. On ne connaît rien sur la fonction de ces différentes protéines. Transposase MADF-like gene Transposon PIF ORF1 ORF2 Domestication DPLG7 DPM7 Casola et al., 2007

22 Diversité fonctionnelle

23 HIM-17(C. elegans)  ségrégation des chromosomes
Diversité fonctionnelle 1. Régulateurs transcriptionels THAP7 (vertébrés)  régulateur transcriptionel via modification de la structure de la chromatine ZBED1 (vertébrés)  activateur transcriptionel de gènes ribosomaux Aft1 (levures)  facteur de transcription impliqué dans l’homéostasie DREF (Drosophile)  facteur de transcription (réplication de l’ADN, différentiation) 2. régulation de la structure de la chromatine CENP-b (mammifères)  ségrégation des chromosomes BEAF-32 (Drosophile)  remodelage de la chromatine, régulation de gènes HIM-17(C. elegans)  ségrégation des chromosomes

24 E93 (drosophile)  activateur de la mort cellulaire autophagique
Diversité fonctionnelle 3. Fonctions apoptotiques THAP0 (vertébrés)  médiateur de l’apoptose induite par le stress THAP1 (vertébrés)  facteur pro-apoptotique nucléaire E93 (drosophile)  activateur de la mort cellulaire autophagique 4. Contrôle du cycle cellulaire LIN-36/LIN15B (C. elegans)  inhibiteur de la transition G1/S THAP1 (vertébrés)  régulateur de la prolifération des cellules endothéliales 5. Défense contre l’invasion d’ETs Abp1, Cbh1 et Cbh2 (levure)  contrôle de la mobilité de rétrotransposons SETMAR (primates)  suspecté de réguler l’expression de la transposase Hsmar1 PGBD3 (mammifères) suspecté de réprimer la transposition d’éléments piggyBac

25 Protéine domestiquée SETMAR

26 Création de la protéine chimérique SETMAR
- Protéine chimérique: fusion entre domaine SET (activité histone méthyl transférase) et d’un gène complet transposase Hsmar1 (MAR) - Emergence de SETMAR il y a ≈ 50 millions d’années Cordaux et al., 2006 SET MAR 4: conversion ADN non-codant en séquence Exonique (vert); création d’un 2nd intron (bleu) 3: délétion qui élimine le codon-stop SETMAR est une protéine chimérique née de la fusion entre une gène complet de transposase Hsmar1 et un domaine SET. Ce domaien SET a une activité histone methyl transférase. SETMAR a émergé il y a 50 millions d’années. C’est cordaux et al en 2006 qui ont en fait reconstruit l’histoire de l’emergence de SETMAR par des analyse de séquences de différents organismes. C’est ce qui est représenté ici. Cette emergence a eu lieu grace à une succession d’évènements. Tout part d’un domaine SET conservé chez les espèces non anthropoides. Vous avez la struture de ce domaine ici constitué de 2 exons et d’un intron avec un stop codon. Le première evenement est l’insertion d’un transposon HSmar1 dans la lignée primate après la séparation Tarsier/ suivi par l’insertion d’une séquence Alu dans les ITRs -ensuite c’est produit une délétion qui a élimine le codon-stop. Le 4 iéme évènementest la conversion d’ADN non codant en séquence exonique (vert) et la création d’un 2nd intron bleu. Tout ceci pour aboutir à la création d’un gène qui contient 2 introns et 3 exons. 1: insertion d’une copie Hsmar1 dans la lignée primate après la séparation Tarsier/ Anthropoids 2: insertion séquence AluSX dans les ITRs Hsmar1 SET domain : conservés chez les espèces non-anthropoïdes (* codon-stop)= 2 exons/1 intron

27 SETMAR Fonctions biochimiques Rôles biologiques
 Domaine SET  activité histone méthyl transférase  Domaine transposase  préservation d’activités de la transposase ancestrale - fixation à l’ADN des ITRs de manière spécifique, clivage de l’ADN en 5’ mais incapacité à cliver en 3’ les extrémités du transposon - formation complexe synaptique - intégration d’un transposon préclivé en 3’ au sein d’un TA Rôles biologiques - Rôles dans les mécanismes de réparation de l’ADN? - Régulation de l’expression des gènes par des modifications épigénétiques? Chez l’homme, 7000 sites de fixation potentiels dispersés dans le génôme Régulation expression des gènes contrôlant un vaste réseau

28 HARBI1 et NAIF1

29 Transposon Harbinger3_DR
- Superfamille PIF/Harbinger - isolé du génome de zebrafish (Kapitonov and Jurka, 2004) Harbinger3_DR (5 copies) 3599 bp ORF1 ORF2 12 bp ITR 221-aa protein (Myb-like) 343-aa DDE Transposase (Tnp) N C F W W Rôle (s) de la transposase et de la protéine Myb-like dans le mécanisme de transposition??

30 Transposon Harbinger3_DR et protéines domestiquées
Tnp Myb-like D D E (Kapitonov and Jurka, 2004) (Sinzelle et al., 2008) HARBI1 NAIF1 N C D D E N C transposase domestiquée - conservée chez les vertébrés contient une triade catalytique DDE - Rôle ligase/ endonucléase Domaine trihelix Fonction cellulaires?? - proteine nucléaire - conservée chez les vertébrés - Induit l’apoptose quand surexpression (Lv et al.,2006) rôle(s) physiologiques ? Co-domestication des deux protéines d’un même transposon

31 Homologie fonctionnelle
Harbinger3_DR Tnp Harbinger3_DR Myb-like Human HARBI1 Human NAIF1  Interaction physique Interaction Transposase/protéine Myb-like Interaction HARBI1/NAIF1 Localisation subcellulaire Transposase et HARBI1 cytoplasmique Protéine Myb-like et NAIF1 nucléaire Protéine Myb-like permet la relocalisation nucléaire de la transposase protéine NAIF1 permet la relocalisation nucléaire de HARBI1 Activité de fixation à l’ADN NAIF1 et protéine Myb-like sont des protéines de fixation à l’ADN Etude du mécanisme de transposition  fonctions biologiques des protéines domestiquées

32 Références Revues : ETs Revues : - Domestication moléculaire SETMAR
- Wicker, T., Sabot, F., Hua-Van, A., Bennetzen, J. L., Capy, P., Chalhoub, B., Flavell, A., Leroy, P., Morgante, M., Panaud, O., Paux, E., SanMiguel, P. and Schulman, A. H. (2007). A unified classification system for eukaryotic transposable elements. Nat Rev Genet. 8, - Craig, N. L., Craigie, R., Gellert, M. and Lambowitz, A. M. (2002) Mobile DNA II. ASM Press, Washington, D.C. Revues : - Domestication moléculaire - Volff, J. N. (2006) Turning junk into gold: domestication of transposable elements and the creation of new genes in eukaryotes. Bioessays 28, Feschotte, C. and Pritham, E. J. (2007) DNA transposons and the evolution of eukaryotic genomes. Annu Rev Genet. 41, SETMAR Cordaux, R., Udit, S., Batzer, M. A. and Feschotte, C. (2006) Birth of a chimeric primate gene by capture of the transposase gene from a mobile element. Proc Natl Acad Sci U S A. 103, Miskey, C., Papp, B., Mátés, L., Sinzelle, L., Keller, H., Izsvák, Z.and Ivics, Z. (2007) The ancient mariner sails again: transposition of the human Hsmar1 element by a reconstructed transposase and activities of the SETMAR protein on transposon ends. Mol Cell Biol. 27, HARBI1 et NAIF1 -Sinzelle, L., Kapitonov, V. V., Grzela, D. P., Jursch, T., Jurka, J., Izsvák, Z. and Ivics, Z. (2008) Transposition of a reconstructed Harbinger element in human cells and functional homology with two transposon-derived cellular genes. Proc Natl Acad Sci U S A. 105,