TAXONOMIE INTRODUCTION Comprendre le monde qui vous entoure !

Présentation au sujet: "TAXONOMIE INTRODUCTION Comprendre le monde qui vous entoure !"— Transcription de la présentation:

1 TAXONOMIE INTRODUCTION Comprendre le monde qui vous entoure !
| Cette présentation a été compilée par BioNET (Posa Skelton et Kornelia Rassmann) Avec l'apport de INTRODUCTION Henrik Enghoff Muséum d'Histoire naturelle du Danemark Ulf Gärdenfors Art Databanken, Centre Suédois d'Information sur les Espèces. Fabian Haas Entomologie en Afrique pour l’Alimentation et la Santé. Chris Lyal Muséum d'Histoire Naturelle, Londres. Yves Samyn Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique. Ensifera ensifera (Boissonneau, 1840) Dessin : Ernst Haeckel

2 QUI SUIS-JE? INTRODUCTION
Voulez-vous le savoir? Demandez à un taxonomiste La Terre est peuplée de nombreuses créatures que nous connaissons et de millions d’autres que nous ne connaissons pas. C’est seulement à travers l'aide de la taxonomie que nous pourrons commencer à démêler ces mystères et serons en mesure d’évaluer quantitativement notre Monde Biologique. Comment gérer correctement quelque chose qui n’a même pas encore été mesuré ? Ou cliquez sur ce lien… © Stuart Wynne

3 LA TAXONOMIE EST… la science de la LA TAXONOMIE C‘EST des organismes
découverte dénomination description classification des organismes LA TAXONOMIE C‘EST La taxonomie est une discipline organisée avec des règles et des procédures claires . C'est ‘la théorie et la pratique’ de la classification des organismes [Code International de Nomenclature Zoologique]. La taxonomie est la base de tout travail biologique. C'est un large parapluie qui abrite l’ensemble des disciplines scientifiques traitant des organismes. La taxonomie est reconnue par la Convention sur la diversité biologique des Nations Unies, signée par la plupart des chefs des gouvernements de la planète , comme un ingrédient essentiel pour sa bonne mise en œuvre. Le nom est tiré des mots grecs : taxis, qui signifie arrangement ou division; et nomos, qui signifie loi. La taxonomie est donc 'une loi d'arrangement ou de division'. [Prof Henrik Enghoff, Musée d'Histoire Naturelle du Danemark] afin de comprendre la biodiversité (et plus…) Le mot ‘Taxonomie’ provient du grec : taxis = division/arrangement; nomos = loi

4 LA DECOUVERTE LA TAXONOMIE C‘EST
La découverte de nouveaux organismes est la première étape de la taxonomie. Chaque année, de nouvelles découvertes sont faites dans le monde entier, parce que les taxonomistes explorent de nouvelles zones, ou grâce à de nouveaux outils disponibles pour l’analyse des spécimens. LA TAXONOMIE C‘EST Poisson Dracula Danionella dracula Découvert en Birmanie Décrit en 2009 © Ralf Britz | Muséum d’Histoire Naturelle, Londres

5 LA DENOMINATION LA TAXONOMIE C‘EST
Electrolux addisoni (Compagno & Heemstra, 2007) Qu’est-ce qu’un nom ? Un nom scientifique est le passeport grâce auquel on connaît tous les organismes. LA TAXONOMIE C‘EST En général, un nom contient des éléments descriptifs comme pour cette raie piquante d’Afrique du Sud récemment décrite. Le genre Electrolux reflète le fait que cette raie dégage du courant électrique et présente des taches lumineuses partout sur son corps. Le nom d'espèce addisoni a été donné pour honorer le collectionneur - Henry Addisone. Photo: Phil Heemstra | Wikimedia Commons Et non pas votre aspirateur moyen !

6 LA DESCRIPTION LA TAXONOMIE C‘EST
A ce stade du processus, il faut comparer l’organisme à ceux qui lui sont proches pour confirmer si l'espèce est nouvelle. LA TAXONOMIE C‘EST La taxonomie est de la description d'organismes. Les termes utilisés pour la description varient selon les organismes, comme ceux montrés dans l’exemple de grenouille ci-dessus. En utilisant les terminologies correctes, d'autres spécialistes des grenouilles (des Herpétologistes) comprendront les caractères de la grenouille. Hypsiboas calcaratus (Troschel, 1848) | Photo: P. J. R. Kok

7 LA CLASSIFICATION LA TAXONOMIE C‘EST Règne - Animalia
Mon nom est Dolly ! Règne - Animalia Phylum - Chordata Classe - Mammalia Sous-classe - Eutheria Ordre - Artiodactyla Famille - Bovidae Sous-famille - Caprinae Genre - Ovis Espèce - Ovis aries LA TAXONOMIE C‘EST Une fois qu’un organisme, a été découvert, décrit et nommé, il est alors classifié pour montrer sa relation avec d'autres organismes. La classification a tendance à changer au fur et à mesure des nouvelles découvertes, celles-ci permettront de prouver ou de réfuter les relations supposées entre les espèces. La génétique a significativement changé notre compréhension des relations entre les organismes, et a entraîné des modifications des systèmes de classification traditionnels.

8 La CLASSIFICATION nous sert dans la vie quotidienne
La classification fait partie de notre vie quotidienne. Elle nous permet d’ordonner les choses, comme lors de l’inventaire des stocks d’un supermarché. Chercheriez-vous des produits laitiers à côté des produits nettoyants ? LES NOMS COMPTENT Photo: G. R. South

9 Les NOMS nous servent dans la vie quotidienne
? Photo: Sergio Kaminski |Wikimedia Commons Dessin: Peter Aertsen LES NOMS COMPTENT Imaginez si les gens et les objets n'avaient pas de nom … Photo: Wikimedia Commons | domaine public

10 Les NOMS sont nécessaires à la communication
Muis Ratón Les noms communs ou vernaculaires sont utiles pour la communication au quotidien, mais ils sont limités au pays et à la langue des utilisateurs マウス فأس Ποντίκι LES NOMS COMPTENT Souris 쥐 Мышь Nous communiquons sur les espèces en utilisant leurs noms communs ou vernaculaires, mais ces noms sont limités par la langue et le lieu où vit l’utilisateur. Ils varient d'un endroit à un autre. Mouse Mus Maus 老鼠 © Kornelia Rassmann

11 Les NOMS SCIENTIFIQUES servent à une communication mondiale
Alternanthera philoxeroides Bursaphelenchus xylophilus LES NOMS COMPTENT Photo: Gary Buckingham Service de Recherches Agricoles de l’USDA , Etats-Unis| forestryimages.org Photo: L.D. Dwinell Service Forestier de l’USDA, Etats-Unis | forestryimages.org Pseudophilotes sinaicus Un nom scientifique certifie que nous parlons du même organisme indépendamment de notre emplacement géographique ou langue Photo: BioNET-NAFRINET

12 CONNAÎTRE un NOM correct - permet d‘économiser de l‘argent
LES NOMS COMPTENT Scotinophara lurida Photo: Natasha Wright, Département de l’Agriculture et des Services Publics de Floride, Bugwood.org Photo: Oliver Spalt | Wikimedia Commons La taxonomie a permis d’identifier 24 ‘punaises noires’ différentes aux Philippines, dont 2 seulement étaient des parasites se nourrissant de riz. Cette découverte permet d’économiser des millions de dollars sur l'utili- sation d'insecticides et aussi de mieux sauvegarder l'environnement. Voir l’étude de cas n° 39 de

13 MECONNAITRE un NOM - peut tuer !
LES NOMS COMPTENT La taxonomie nous permet de comprendre la Biodiversité. Vous devez connaître les espèces qui vous entourent afin de savoir lesquelles sont comestibles, lesquelles sont toxiques et celles qui ont des intérêts médicinaux ou autres. Par exemple, pendant des siècles, les populations ont appris – en général, en essayant et parfois, en se trompant - à distinguer les champignons toxiques des champignons comestibles, comme illustré sur la diapositive. Boletus aurantiacus | Photo: Wikimedia Commons | domaine public Comestible ou pas comestible ? Demandez à un spécialiste des champignons (mycologiste) !

14 LINNAEUS LES NOMS COMPTENT
"Si vous ne connaissez pas les noms des choses, leur connaissance est inutile " Critica Botanica 1737 LES NOMS COMPTENT Carl von Linné (ou Linnaeus), "le père de la taxonomie", a posé les bases du système moderne de nomenclature - la discipline qui nomme les espèces. Carl von Linné, Dessin: Bibliothèque AMNH Linnaeus a donné à la classification la cohérence et la précision nécessaires pour décrire la biodiversité, négocier les matières premières, acheter les semences pour l'agriculture, gérer les parasites, ou traiter avec n’importe lequel des nombreux secteurs dans lesquels l’Homme a besoin des connaissances taxonomiques. Linnaeus a associé à chaque nom d’usage un nom descriptif, en utilisant un système binomial : un nom en un mot qui indique le genre (par exemple le genre Canis comprenant les loups, les chiens et les dingos) et un nom en deux mots comme Canis lupus ("le loup") pour l'espèce individuelle au sein de son genre. Linnaeus a présenté ce système de nomenclature en deux mots pour chaque espèce dans ses œuvres complètes. Les naturalistes ont tout de suite trouvé ce système indispensable. Au cours de la deuxième moitié du 18ème siècle, son système fut adopté par l’ensemble des botanistes et des zoologistes de l’époque.

15 PERTINENCE ET RAPPORT avec la BIODIVERSITÉ
© A. De Kesel La taxonomie est utile pour tous les secteurs liés directement ou indirectement à la biodiversité. Si vous êtes impliqués dans le commerce d'importation / d'exportation, la sécurité alimentaire, la médecine et la santé publique, le changement climatique, la biosécurité, l'agriculture, l'horticulture, la pêche, la science vétérinaire, l'extraction, le tourisme, l'élevage – ou travaillez en cuisine, certains aspects de tous ces secteurs exigent la connaissance du Monde Vivant. TAXONOMIE - AVANTAGES La taxonomie nous permet de comprendre notre biodiversité.

16 COMPREHENSION DU MONDE VIVANT
© Kornelia Rassmann La diversité rend notre monde vivant plus complexe. La taxonomie nous aide à mieux comprendre cette diversité en arrangeant et catégorisant notre monde vivant en unités intelligibles. TAXONOMIE - AVANTAGES

17 Avantages de la TAXONOMIE pour le bien-être humain
La taxonomie fournit des informations de base et indispensables dans beaucoup de domaines d'intérêt pour l’homme comme la conservation de la biodiversité, l'adaptation aux changements climatiques, la biosécurité , l'agriculture, l'aquaculture, la santé, le tourisme, le commerce, et beaucoup d’autres encore. TAXONOMIE - AVANTAGES Photo: Bigstockphoto.com Photo: ??? Photo: Posa A. Skelton

18 La TAXONOMIE a une importance mondiale
Elle aide aux prises de décisions avisées des politiques et des organismes de réglementation, fournit des services discrets mais essentiels pour de nombreuses industries (comme en agriculture, ou pour les laboratoires pharmaceutiques) et est une infra-structure fondamentale pour les Objectifs du Millénaire pour le Développement qui sont de réduire la pauvreté, combattre les maladies et préserver l’environnement. TAXONOMIE - AVANTAGES © Kornelia Rassmann

19 Une base de CONNAISSANCES pour d'autres sciences
La taxonomie soutient diverses disciplines scientifiques comme la biologie de la conservation, la biologie de l’évolution, la biodécouverte, l'écologie, la biogéographie, la médecine et de nombreuses autres disciplines encore. TAXONOMIE - AVANTAGES Photo: G. R. South La taxonomie est non seulement une aide essentielle pour de nombreuses autres disciplines biologiques comme la biologie de l’évolution, la biologie de la conservation, l'écologie, la biogéographie, la phylogénie, etc, mais aussi une partie intégrante d'autres sciences comme la médecine, la chimie, la pharmacie et de nombreuses autres encore. Photo: BioNET-MESOAMERINET

20 Conservation de la BIODIVERSITE
En connaissant notre biodiversité, nous pouvons la conserver et l'utiliser de façon durable. Par exemple : De nombreuses réserves naturelles ont été établies grâce à la découverte d’une espèce rare, ou la redécouverte d'une espèce qu’on pensait éteinte. TAXONOMIE - AVANTAGES La taxonomie est une base de connaissances pour conserver et partager les avantages de la biodiversité. En connaissant notre biodiversité, nous pouvons la conserver et l'utiliser durablement pour le bien des communautés. Par exemple, l'écotourisme est une source de revenu potentiel pour les communautés isolées des pays en développement, puisque les visiteurs veulent mieux connaître l'environnement dans lequel ils sont en vacances et souhaitent apprendre les noms taxonomiques (local et scientifique) de la biodiversité du lieu qu'ils visitent. © Posa A. Skelton Brachylophus bulabula – un nouvel iguane endémique de Fidji

21 CHANGEMENTS CLIMATIQUES
Adaptation aux CHANGEMENTS CLIMATIQUES A cause des changements climatiques, on s'attend à ce que les distributions d’espèces soient modifiées. Les collections taxonomiques fournissent des données permanentes de la distribution des espèces au cours du temps, elles permettent de prédire la fréquence des extinctions, des parasites et des maladies et soutiennent les mesures d’adaptation de l'écosystème. TAXONOMIE - AVANTAGES © Gert Brovad

22 Gestion des ESPECES ENVAHISSANTES & des PARASITES
Le scarabée Cyrtobagous salviniae est un agent de contrôle biologique de la « mauvaise herbe » Salvinia molesta, un parasite aquatique majeur. Les espèces envahissantes touchent presque tous les types d’écosystème sur la planète et constituent une grande menace pour la biodiversité. La gestion de ces risques nécessite le travail de taxonomistes expérimentés et bien équipés capables de fournir des informations sur les espèces et des outils d'identification rapide nécessaires aux gestionnaires et à la société civile. TAXONOMIE - AVANTAGES La taxonomie permet une identification correcte des espèces, y compris des parasites (Salvinia sp.) et de leurs prédateurs (Cyrtobagous salviniae). Elle permet ainsi d’utiliser le contrôle biologique dans la gestion des espèces envahissantes. Photo: Katherine Parys, Université de l’Etat de Louisiana, Etats-Unis Voir étude de cas no. 27

23 POLITIQUE/PRISE DE DÉCISIONS
Les informations taxonomiques aident aux prises de décisions des politiques et d'autres cadres réglementaires. Par exemple : La Convention sur le commerce international des espèces de faune et de flore sauvages menacées d'extinction(CITES ) repose sur des informations taxonomiques correctes pour permettre un contrôle approprié du commerce des espèces vulnérables comme les orchidées. Les Annexes de la CITES sont des listes où figurent les espèces bénéficiant de différents niveaux ou types de protection face à la surexploitation. TAXONOMIE - AVANTAGES La taxonomie fournit les informations pour aider aux prises de décisions des politiques et d'autres cadres réglementaires. Par exemple, la Convention sur le Commerce International des Espèces de faune et de flore sauvages menacées d’extinction (CITES), nécessite des informations taxonomiques correctes pour permettre de contrôler correctement le commerce d'espèces vulnérables. Presque toutes les orchidées sont inscrites à la CITES, la majorité en Annexe II, qui inclut les espèces qui ne sont pas menacées d'extinction actuellement, mais qui pourraient le devenir si leur commerce n’est pas étroitement contrôlé. © Martin Voggenreiter sens horaire : Ophrys fusca, Orchis italica, Cypripedium calceolus, Ophrys lutea

24 BIODECOUVERTE & SANTE TAXONOMIE - AVANTAGES
Les plantes médicinales sont importantes dans de nombreuses parties du monde et la taxonomie nous fournit l'identité des plantes utiles, comme le nono, fruit de Morinda citrifolia. TAXONOMIE - AVANTAGES © Posa Skelton - Morinda citrifolia Les éponges marines sont la source de nombreux composés utilisés pour la fabrication de médicaments, d’ingrédients alimentaires et d'autres matières à usage commercial. La taxonomie permet de les découvrir et de les identifier. © Stuart Wynne - Niphates digitalis

25 BIOSECURITE & COMMERCE
Quand un insecte inconnu est trouvé dans une cargaison agricole, le commerce global est ralenti et les expéditions sont retenues le temps de l'identification, à un coût élevé. Un support taxonomique rapidement disponible économise de l'argent. TAXONOMIE - AVANTAGES La présence présumée de la carie de Karnal (champignon) dans le blé australien a conduit au refus d'une expédition vers le Pakistan. La taxonomie a montré qu’il s’agissait de spores d'une espèce proche mais non-envahissante et l’exportation du blé d’une valeur de 4 milliards de dollars a été effectuée. Des exportations de blé vers le Pakistan ont été refusées à cause de la présence (présumée) de la carie de Karnal (Tilletia indica) dans des expéditions. La carie de Karnal n’a jamais été signalée en Australie. Les espèces aux spores ressemblantes sont : Tilletia walkeri - ray-grass – présente en Australie ; Tilletia horrida - riz - pas en Australie ; Tilletia ehrhartae - Ehrharta – présente en Australie ; Tilletia rugispora - Paspalum - pas en Australie. Les échantillons de chaque entrepôt portuaire de blé ont été examinés en Australie - un protocole de diagnostique national ayant été mis en place. Sur la base de comparaison avec des herbiers, des spores semblables au T. indica ont été trouvées dans 60 % des échantillons, mais aucun T. indica. Le champignon identifié était T. ehrhartae. Cela a rassuré les partenaires commerciaux sur le fait que le commerce australien est contrôlé scientifiquement et conduit à une reprise du commerce d'exportation de blé, d’une valeur de 4 milliards de dollars. Pour une étude de cas similaire voir l’étude de cas no. 8 Tilletia indica|Photo : Ruben Durán, Université de l’Etat de Washington, Bugwood.org

26 RÉDUCTION DE LA PAUVRETÉ et SÉCURITÉ ALIMENTAIRE
L'allégement de la pauvreté, la sécurité alimentaire et la conservation de la biodiversité sont étroitement liés. À l'échelle mondiale, pauvreté et insécurité alimentaire sont souvent localisées là où la perte de biodiversité est particulièrement prononcée. La connaissance taxonomique aide à maintenir des écosystèmes sains dans les pays en voie de développement, où se trouvent la plus grande biodiversité sur Terre, mais aussi le nombre le plus élevé de populations rurales à faible revenu menacées par la perte de biodiversité. TAXONOMIE - AVANTAGES © bluerain | Dreamstime.de © imagedirekt.de

27 TAXONOMIE: progrès de nos connaissances
A l’heure actuelle, près de 1,8 millions d'espèces ont été dé- crites, cependant, les estimations du nombre total d'espèces varient entre 5 et 50 millions. Juste un exemple: dans une étude d'environ 500 espèces de crickets australiens, 76 % d'entre elles ont été décrites comme nouvelles. D'Otte, D. et R. D. Alexander Les Crickets Australiens (Orthoptera : Gryllidae). Académie des Sciences Naturelles de Philadelphie. nouvelles espèces ont été décrites en 2007 LE DEFI Unka boreena (Otte & Alexander) | Photo: David Rentz

28 GROSSES PELUCHES… Il n’y a pas que les LE DEFI
La taxonomie ne concerne pas que les espèces emblématiques, connues du grand public, comme le panda géant, la baleine bleue et l’ours blanc. LE DEFI © Tatiana Goydenko | Dreamstime.com Il y a aussi de petites créatures qui régissent nos écosystèmes. Certains de ces petits organismes peuvent avoir des impacts significatifs sur nos vies, à la fois positifs (comme les levures) et négatifs (comme les moustiques vecteurs de malaria)! © Josef Szasz–Fabian | Dreamstime.com 28

29 MERVEILLEUX Quel MONDE LE DEFI Notre planète recèle
de nombreux trésors et merveilles – de nouvelles espèces sont découvertes chaque jour, cependant ces découvertes suscitent souvent peu d'attention de la part d'Homo sapiens. Cette espèce – décrite pour la 1ère fois en est le plus petit hippocampe connu avec une longueur standard de 13,8 mm et une hauteur moyenne de 11,5 mm. LE DEFI Hippocampus satomiae | © Rudie Kuiter © John Sear 29

30 Intéressé par la TAXONOMIE ?
Vous trouverez plus d'informations sur... La Taxonomie Initiative Mondiale de la Taxonomie (GTI, Convention sur la Diversité Biologique) European Distributed Institute of Taxonomy (EDIT)| Muséum d'Histoire Naturelle, Londres, ROYAUME-UNI|Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique| BioNET-international Les Espèces Encyclopedia of Life (EoL) |Wikispecies | ARKive |Liste Rouge de l’IUCN | Top 10 New Species Discoveries International Institute for Species Exploration (IIES) | Tree of Life| Census of Marine Life (CoML) | Catalogue of Life (ITIS, Species2000) | Global Biodiversity Information Facility (GBIF) L'importance de la taxonomie, des espèces et de la biodiversité Etudes de cas de BioNET |Etude de cas du GTI sur la taxonomie et les changements climatiques|Convention sur la Diversité Biologique – 2010 Année Internationale de la Biodiversité INFORMATION Photos: BioNET-SAFRINET, BioNET ANDINONET, BioNET-EAFRINET, BioNET-NAFRINET