BEAUCOUP de gènes et PEU d’épistasie

Présentation au sujet: "BEAUCOUP de gènes et PEU d’épistasie"— Transcription de la présentation:

1 BEAUCOUP de gènes et PEU d’épistasie
Modèle additif multi-locus

2 Les expériences de réponse à long terme à la sélection
« Illinois Long Term Selection Corn Experiment » Dudley & lambert, 1992.

3 Le polymorphisme permettant une réponse soutenue à la sélection est:
Infini (modèle infinitésimal) Caché (linkage) Régénéré régulièrement (mutations)

4 Les modèles de réponse à long terme à la sélection
Fisher, 1930 Hill, 1982 Weber and Diggins, 1990 Lynch and Walsh, 200x Modèle infinitésimal populations infinies + mutations Réponse à la sélection Yoo, 1980 + dérive génétique Robertson, 1960 Bulmer, 1971 Chevalet, 1988 + linkage Générations (D’après les données de Yoo, 1980)

5 Le polymorphisme est caché (linkage)
Comment est structuré le polymorphisme sélectionné le long du génome ? Réserve de polymorphisme dans des segments à forte densité de gènes ? à court terme / dans une population ? à long terme ? Thèse Emmanuelle Della-Chiesa

6 Effet Bulmer (1971) P=seuil sélection P= G + E = iXi + E
P=X1+X2 Cov(X1,X2)<0 X1 P= G + E = iXi + E Var(G) = i Var(Xi) + ij Cov(Xi , Xj) Var(G) = Vg C (C<0) La variance disponible pour la sélection est réduite

7 Déséquilibre de liaison entre paires de locus
« moins fortement » négatif entre locus éloignés « fortement » négatif entre locus proches

8 Effet Hill-Robertson (1966)
Dérive génétique + Liaison + Sélection des allèles favorables Augmentation de la probabilité de fixation des allèles défavorables

9 La recombinaison restaure la variance « cachée »
mutation ? Hospital & Chevalet, Genetical Research, 1996.

10 Répartition aléatoire du polymorphisme
Distances entre locus Répartition aléatoire du polymorphisme Répartition observée sous sélection t=50 t=50 AVEC MUTATION SANS MUTATION t=200 t=200 Indice d’agrégation au cours du temps

11 Structuration du polymorphisme sélectionné
A court terme, agrégation transitoire du polymorphisme dans une population Importance en sélection artificielle (SAM) Faible impact sur le maintien du polymorphisme avec mutation-sélection Fixations successives de mutations +/- indépendantes Effets sur la divergence entre populations ?

12 Impact de l’histoire sélective des populations sur l’architecture apparente des caractères quantitatifs population Lignée H’ Lignée H Lignée L sélection Croisement Détection QTL Divergence entre lignées HH’: