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Génétique Groupe 41 CONNAN Delphine LOPEZ Lise MOROS NICOLAS Carla ROZAND Camille.

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1 Génétique Groupe 41 CONNAN Delphine LOPEZ Lise MOROS NICOLAS Carla ROZAND Camille

2 Paramètres génétiques de la croissance et des caractéristiques de la carcasse basés sur la tomographie informatisée in vivo, chez les lapins de souche Pannon White

3 Objectif Estimation des paramètres génétiques concernant la croissance et les caractéristiques de la carcasse : Estimation des paramètres génétiques concernant la croissance et les caractéristiques de la carcasse : Gain Quotidien Moyen mesuré entre 5 et 10 semaines (GQM) Gain Quotidien Moyen mesuré entre 5 et 10 semaines (GQM) Aire de section du muscle Longissimus dorsi (mesure entre vertèbres lombaires 2-3 et 4-5) (L) Aire de section du muscle Longissimus dorsi (mesure entre vertèbres lombaires 2-3 et 4-5) (L) Rendement carcasse (mesure à lâge de mise sur le marché) (DoP) Rendement carcasse (mesure à lâge de mise sur le marché) (DoP)

4 Matériel et Méthode Population de départ Population de départ Croisement à 3 voies : Croisement à 3 voies : Mères issues du croisement entre 2 lignées maternelles (effet hétérosis) Mères issues du croisement entre 2 lignées maternelles (effet hétérosis) Pères : lignée pure issue dune sélection sur GQM et poids corporel à lâge de vente Pères : lignée pure issue dune sélection sur GQM et poids corporel à lâge de vente Lapins Pannon White sélectionnés pour la viande Lapins Pannon White sélectionnés pour la viande

5 Management de la population Management de la population lapins nés entre 2000 et 2003, issus de 5044 portées lapins nés entre 2000 et 2003, issus de 5044 portées Nombre de base : 149 Nombre de base : 149 Nourriture Nourriture Sélection des animaux : GQM > moyenne du lot Sélection des animaux : GQM > moyenne du lot 45g pour les femelles 45g pour les femelles 47,6g pour les mâles 47,6g pour les mâles Tomographie (cm²) Tomographie (cm²) Pourcentage carcasse = (poids carcasses froides/ poids vif)*100 Pourcentage carcasse = (poids carcasses froides/ poids vif)*100

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7 Estimation des paramètres génétiques Estimation des paramètres génétiques Modèle animal multivarié, approche Bayésienne Modèle animal multivarié, approche Bayésienne Estimation des composantes de la variance pour GQM, L, DoP Estimation des composantes de la variance pour GQM, L, DoP Prise en compte de leffet âge, nichée et génétique additif pour les 3 caractères Prise en compte de leffet âge, nichée et génétique additif pour les 3 caractères Prise en compte du PC pour L seulement, et de lâge de labattage pour DoP Prise en compte du PC pour L seulement, et de lâge de labattage pour DoP Amplification de données pour obtenir un même type de matrice pour les 3 Amplification de données pour obtenir un même type de matrice pour les 3

8 Modèle obtenu : (y/b,c,a,R)~N(Xb+Za+Wc,Ro In) y : séquence des enregistrements pour GQM, L, DoP X,Z,W : matrices connues In : matrice identité Ro : matrice résiduelle de variance b : affecté d une distribution uniforme délimitée a : effets génétiques supposés gaussiens : a~N(0,Go A) A: matrice en relation avec les effets génétiques additifs Go: matrice de la variance génétique additive c : effets nichée supposés indépendants et gaussiens : c~N(0, Co Io) Co : matrice de la variance additive commune pour la taille de la portée Io : matrice identité

9 Echantillonage de Gibbs Echantillonage de Gibbs Algorithme : estimer les distributions ultérieures encore inconnues Algorithme : estimer les distributions ultérieures encore inconnues + amplification de données + amplification de données

10 Résultats et discussion Effets génétiques additifs Effets génétiques additifs - moyennes et médianes quasi égales -héritabilité GQM : - modérée - ne diffère pas de estimation prévue (0,25) - post-sevrage : entre 0,11 et 0,48 - augmente avec lâge -héritabilité de L : -modérée, au moins 0,26 -héritabilité de DoP -assez élevée, au moins 0,22

11 Effet nichée (c²) Effet nichée (c²) -moyenne et médiane quasi identique -Effet moyen pour GQM (moins expliqué par la variance phénotypique totale que par les effets génétiques additifs). Max 0,22, plus haut si animal jeune -valeur plus basse pour L et DoP car animaux plus âgés Effet maternel génétique (m²) Effet maternel génétique (m²) pas examiné dans cette étude

12 Coefficient de corrélation génétique Coefficient de corrélation génétique - Entre GQM et caractéristiques de carcasse (L et DoP) moyen et négatif - Relation entre GQM et DoP expliquée par changements allométriques - Non favorable pour la croissance des lapins car un des critères de sélection est le GQM - Si sélection sur GQM, augmentation du PC aussi ( ! obésité) - Poids fixé pour labattage rendement carcasse plus faible - Corrélation relativement forte entre L et DoP - Possibilité de sélection sur DoP

13 Conclusion Héritabilité moyenne de L et corrélation positive et assez élevée entre L et DoP Sélection possible sur DoP Héritabilité moyenne de L et corrélation positive et assez élevée entre L et DoP Sélection possible sur DoP Mais réponse attendue sûrement moindre car corrélation à celle de L Mais réponse attendue sûrement moindre car corrélation à celle de L Alternative : sélection sur L (idéal) mais prix élevé de la tomographie et un seul endroit! Alternative : sélection sur L (idéal) mais prix élevé de la tomographie et un seul endroit! ! Diminution du GQM si sélection sur L ! Diminution du GQM si sélection sur L période dengraissement plus longue : économie?? Qualité de la viande ? Qualité de la viande ?

14 Bibliographie Nagy I.,Ibàñez N. et al. Genetic parameters of growth and in vivo computerized tomography based carcass traits in Pannon White rabbits. Livestock science. 2006, 104 : Nagy I.,Ibàñez N. et al. Genetic parameters of growth and in vivo computerized tomography based carcass traits in Pannon White rabbits. Livestock science. 2006, 104 : hort%20Papers/ _SZEZSOP2_mod.pdf hort%20Papers/ _SZEZSOP2_mod.pdf hort%20Papers/ _SZEZSOP2_mod.pdf hort%20Papers/ _SZEZSOP2_mod.pdf


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