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SBIM - 06/06/2014 Grenoble 21-22 décembre 2004 6ème Séminaire synthèse technologique & GENNERE.

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1 SBIM - 06/06/2014 Grenoble décembre ème Séminaire synthèse technologique & GENNERE

2 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Ben Saïd M, Richard JB, Le Mignot L, Taupin P, Dufour E, Mugnier C, X Ferreira, JP Necker Toubiana* L, Jais JP, Landais P. EA222, hôpital Necker Université Paris 5 & *U444 INSERM

3 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN 1. Montée en charge 2. Réseau humain 3. Architecture du SI 4. Aspects techniques 5. Aspects fonctionnels 6. Contrôle de qualité 7. Nouvelles fonctionnalités 8. Évolution 9. Communications

4 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Décembre 2004 Montée en charge

5 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Novembre régions + la Pédiatrie Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre Provence Alpes-Côte-dAzur Pédiatrie Ile-de-France jan juin 2002 jan jan nov. 2004

6 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN décembre 2004 Avril 2001 e-bordereau Déc 2000 Client-léger 21 jan 2002 Limousin – SIMS-REIN Juin 2002 Languedoc Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre PACA Pédiatrie Ile-de-France 9080 patients COS 23 Nov 2004 COS Oct 2003 Jan 2003 Champagne Ardenne Jan 2004 Centre – PACA – Pédiatrie - IDF 8858 Grenoble 21 déc 2004

7 SBIM - 06/06/ dossiers de patients dialysés 7576 dossiers de patients vivants État Décembre 2004

8 SBIM - 06/06/2014 État déc : 7576 patients vivants Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre Provence Alpes Côte dAzur Pédiatrie Ile de France greffés hors région

9 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN : Outil - Flux & trajectoires des patients en IRTT Total des transferts dune unité de dialyse vers la dialyse: dans une même région (1654) dans une autre région (111) vers la transplantation de la transplantation vers la dialyse

10 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN : Recueil des informations longitudinales - recueil du suivi annuel Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne 215/ / / / /

11 SBIM - 06/06/2014 Démarrage dune nouvelle région (1) Identification des acteurs : - Médecin régional, - médecin de santé publique, - attaché de recherche Clinique Identification des structures de soins de la région et des utilisateurs (profils) Dossier des préconisations SIMS et accompagnement des utilisateurs et des ARCs

12 SBIM - 06/06/2014 Démarrage dune nouvelle région (2) Intégration dans SIMS-REIN des données existantes Enquête CNAM-DHOS 2003 Bases locales - patients incidents à partir de juin 2003

13 SBIM - 06/06/2014 Intégration dans SIMS-REIN des données de lenquête CNAM-DHOS 2003 Gestion des données nominatives absentes de la base de lenquête CNAM-DHOS 2003 Gestion des données incomplètes, des doublons, du codage médical Gestion de laffectation des patients dans les unités de soins

14 SBIM - 06/06/2014 État nov : intégration dans SIMS-REIN des données de lenquête CNAM 3800 dossiers de patient : région CENTRE, 2600 en PACA - Complément et contrôle de qualité des données par les ARCs - Restent près de 1000 dossiers à vérifier dont plus de 900 en PACA

15 SBIM - 06/06/2014 État 20 déc : intégration dans SIMS-REIN des données de lenquête CNAM 3800 dossiers de patient : Restent 6 dossiers à vérifier en PACA Contrôle de qualité des données de 2 à 5 mois après lintégration des données de la région PACA et la région Centre dans SIMS-REIN

16 SBIM - 06/06/2014 Démarrage dune nouvelle région (3) Montée en charge en 2005 : Ile de France (2 ARCs +/- 1 ARC) Midi- Pyrénées (1 ARC) Basse Normandie (1 ARC) Bourgogne (?) Pays de Loire (?)

17 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Décembre 2004 le réseau humain

18 SBIM - 06/06/2014 Les néphrologues et SIMS-REIN 170 codes daccès à lapplication pour 337 unités de soins Le réseau na pu se développer quavec la contribution de lensemble des acteurs

19 SBIM - 06/06/2014 Les médecins coordinateurs J-C. Aldigier F. de Cornelissen H. Maheut S. Baudin, F. Von Ey P. Brunet, R. Sambuc MH. Saïd, P. Niaudet G. Bobrie Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre PACA Pédiatrie Ile-de-France

20 SBIM - 06/06/2014 Les Attachés de Recherche Clinique et SIMS REIN Florence Glaudet Françoise Lebeau Y Duny Marie-Dominique Lorenzi Claudette Berquez Anne-Claire Durand Pierre Taupin Patricia Chaignot Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre PACA Ile-de-France

21 SBIM - 06/06/2014 A. Vergnenègre J-P. Daurès F. Vitry J-M. Halimi J-C. Delaroziere P. Landais Limousin Languedoc Roussillon Champagne Ardenne Centre PACA Pédiatrie Ile-de-France Structures dAppui Épidémiologique

22 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Décembre 2004 Aspects techniques et fonctionnels

23 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Décembre 2004 Serveur didentité

24 SBIM - 06/06/2014 clients universels clients universels données Base dévènements Base didentité Datamart REIN SIMS : une architecture n-tier serveur web dynamique Fonctions métiersInterface Web JSP Servlets Serveurs dévènements alimentation Serveurs didentités intégrateur

25 SBIM - 06/06/2014 Dossier CNIL (Annexes n° 5, 7, 8, 12, 13 & 14) Mise en œuvre de lapplication « Système dInformation Multi-Sources du Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie »

26 SBIM - 06/06/2014 Architecture du SI interface gestion des droits création modification lecture reconnais- sance identité algorithme comparaison BDD apprentissage synchro batch

27 SBIM - 06/06/2014 Serveur didentité Données médicales N° Patient Données médicales N° Patient Etat civil Client Interface web Découplage identité et données médicales

28 SBIM - 06/06/2014 Création dune base didentifiant dédoublonnage à la source

29 SBIM - 06/06/2014

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31 SIMS-REIN Décembre 2004 notes techniques et fonctionnelles

32 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN aspects techniques et fonctionnels : 1.Environnement 2.Transactions 3.Exports 4.Transferts

33 SBIM - 06/06/2014 Environnement : migration Java Mysql Tomcat XML, logging, assertions robustesse, performances, transactions performances, gestion mémoire

34 SBIM - 06/06/2014 Migration à venir Java Mysql Tomcat metadata, templates,... - requêtes imbriquées, - procédures stockées, - contraintes dintégrité, -fonctionnalités OpenGIS

35 SBIM - 06/06/2014 Au niveau de lapplication : Encapsulation des traitements dans une servlet générique => gestion des connections, erreurs et rollbacks, systématisée Transactions (1)

36 SBIM - 06/06/2014 connexion affichage résultat traitement erreur Écriture Filtre récupération exception Transactions (2)

37 SBIM - 06/06/2014 Transactions (3) Au niveau des données : moteur MyIsam -> InnoDB, compatible ACID - Atomicity - Consistency - Isolation - Durability

38 SBIM - 06/06/2014 Exports (1) Évolution des exports les exports sont structurés pour faciliter leur utilisation : - analyse épidémiologique et demande de soins - analyse de loffre de soins - analyse annuelle - analyse longitudinale

39 SBIM - 06/06/2014 Exports (2)

40 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Décembre 2004 Transferts

41 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN 1.Typologie des problèmes transferts et reconstitution des trajectoires dates 2. aspects fonctionnels : mise à jour annuelle

42 SBIM - 06/06/2014 Transfert vers la greffe (1) Création des unités de greffe : - les transferts de greffe se feront dorénavant dans les unités de greffes - et non plus vers ladministrateur SIMS REIN

43 SBIM - 06/06/2014 Unité de greffe – écriture non autorisée(1)

44 SBIM - 06/06/2014 Unité de greffe – écriture non autorisée(2)

45 SBIM - 06/06/2014 Transfert vers la greffe (4) Administrateur SIMS-REIN CHU Reims CHU La Conception - Marseille CHU Nice CHU Tours CHU Montpellier Ile de France Autres

46 SBIM - 06/06/2014 Autres transferts Le retour à domicile et le départ définitif vers un autre pays restent déclarés à ladministrateur SIMS REIN

47 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Décembre 2004 nouveaux bordereaux

48 SBIM - 06/06/2014 Nouveaux bordereaux Évolution vers le bordereau préconisations du Guide du REIN - modifications mineures dans SIMS REIN : - numéro EfG - qualification des comorbidités - modalités des lieux de traitement - voie dabord vasculaire

49 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Décembre 2004 Sécurité

50 SBIM - 06/06/2014 Composants de la sécurité Intégrité du système –Contre les attaques extérieures –Contre les pannes logicielles ou matérielles Gestion des accès –Authentification –Autorisation –Accounting (Journalisation)

51 SBIM - 06/06/2014 Organisation du système

52 SBIM - 06/06/2014 Principe général La zone production ne communique pas directement avec les autres zones Elle nest accessible que via le mandataire (proxy)

53 SBIM - 06/06/2014 Rôle du pare-feu Routage et filtrage des flux entre les différents segments au niveau des adresses IP et des protocoles (ports) –Protocoles http (port 80) et https (port 443) autorisés en flux entrant sur la zone proxy, interdits vers les autres zones Translation des adresses locales (adressage privé) en adresses publiques légales sur Internet Accounting des règles de filtrage

54 SBIM - 06/06/2014 Rôle du mandataire inverse (reverse proxy) Réécriture des URL publiques en URL privées –http://simsrein.necker.fr/index.html -> Filtrage au niveau applicatif (filtrage des URL) –http://simsrein.necker.fr/cgi/test.cgi Accounting du proxy (Apache mod_proxy) Gestion de SSL (mod_SSL)

55 SBIM - 06/06/2014 Détection dintrusion Carte réseau dédiée sans adresse IP pour lanalyse du trafic Recherche de signatures dattaques (SNORT) Accounting

56 SBIM - 06/06/2014 Pannes logicielles et matérielles Configuration RAID des serveurs Serveur de sauvegarde dédié dans la zone production

57 SBIM - 06/06/2014 Gestion des accès Utilisation du protocole SSL-TLS –Authentification –Cryptage Approche mini-PKI –Certificats serveur –Certificats clients -> distribution des certificats clients ?

58 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Décembre 2004 Contrôle de qualité

59 SBIM - 06/06/2014 Procédures mises en place avec les ARC contrôle de lexhaustivité et de la qualité des données SIMS-REIN : Contrôle de qualité

60 SBIM - 06/06/2014 clients universels clients universels serveur web dynamique données Contrôle exhaustivité et qualité Contrôle exhaustivité et qualité Datamart REIN consolidation Base didentité Vérification didentité Base dévènements Saisie brouillon validation

61 SBIM - 06/06/2014 Contrôle Exhaustivité : Limousin (1) Centre LourdAssociation PMSI Code de Dialyse Z491 Listing secrétariat Patients traités hors région Contact avec les centres de dialyses Complément de la base SIMS REIN

62 SBIM - 06/06/2014 Monitoring du suivi : Limousin (2) SUIVI ANNUEL SUIVI MENSUEL Listing de chaque centre Listing de la base SIMS REIN Patients de SIMS REIN absents du listing des unités Patients absents de SIMS REIN Identification de la sortie de liste Nouveaux patients TRANSFERT GREFFE DECES Edition du listing A laide de loutil Mise à Jour dans SIMS REIN Identification du médecin référent et envoi des fiches Préparation de la fiche SAISIE SIMS REIN

63 SBIM - 06/06/2014 Contrôle Qualité : Languedoc Roussillon (1) contrôle exhaustif : à partir de la liste SIMS REIN vérification exhaustive des 10 items de base contrôle par sondage: Tirage au sort dans la liste SIMS REIN Prise en compte de la taille des échantillons.

64 SBIM - 06/06/2014 Données SIMS REIN comparées aux données des dossiers patients Variables quantitatives: - Coefficient de correlation intra-classe (ICC). Variables qualitatives: - Coefficient Kappa de Cohen - Classification sur léchelle de Landis et Koch - Test de Mac Némar Contrôle Qualité : Languedoc Roussillon (2)

65 SBIM - 06/06/2014 Outils de monitoring. listes de requêtes ciblées,. module dextractions de données,. suivi des mises à jour annuelles SIMS-REIN : Contrôle de qualité Rubrique Infos/outils

66 SBIM - 06/06/2014

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70 Etat suivi « brouillon » ou « validé »

71 SBIM - 06/06/2014 Etat suivi « consolidé » - unité de dialyse

72 SBIM - 06/06/2014 Etat suivi « consolidé » - région

73 SBIM - 06/06/2014 État suivi « exporté » au data warehouse

74 SBIM - 06/06/ : deux objectifs ciblés Stabiliser la cohorte Compléter la montée en charge … et préparer le futur

75 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Décembre 2004 Évolutions du SIMS

76 SBIM - 06/06/2014 SIMS – Évolutions 3/ finaliser le SIGNe : Système dInformation Géographique 1/ développer les outils de reporting 2/ stabiliser lentrepôt de données 4/ développer la modélisation spatio-temporelle

77 SBIM - 06/06/2014 serveur web dynamique Interface WebFonctions métiers clients universels clients universels données Base dévènements Base didentité Datamart REIN Le reporting VUES DWH Outils tableaux de bord SIG Analyses statistiques

78 SBIM - 06/06/2014 Être identifiable, être identifié Créer un site SIMS commun Mise à disposition des informations JP Jais, M Ben Saïd, L Le Mignot, X Ferreira, JP Necker Identifiabilité

79 SBIM - 06/06/2014 Standardiser et automatiser la présentation des grands axes danalyse Pourcentages de cas Taux / 10 6 Incidence selon lâge

80 SBIM - 06/06/2014 adapter lapproche spatio-temporelle aux besoins d'évaluation et de décision simulations et scénarios doptimisation du couple demande/offre de soins Programme de recherche L. Toubiana, J.-B. Richard, P. Landais Développer le SIGNe Programme STIC SANTE INSERM-CNRS

81 SBIM - 06/06/2014 Le Système dInformation Géographique SIGNe

82 SBIM - 06/06/2014 Le Système dInformation Géographique SIGNe

83 SBIM - 06/06/2014 SIGNe : développer la modélisation spatio-temporelle

84 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Décembre 2004 contractualiser

85 SBIM - 06/06/2014 adapter lapproche SIMS aux besoins d'évaluation et de décision en matière dIRT pour la Chine, ville de Shanghai généricité du modèle SIMS appliqué à une autre affection chronique : la polyarthrite rhumatoïde Programme GENNERE Michel Simonet, Didier Guillon, Paul Landais Faire fructifier les partenariats GENNERE

86 SBIM - 06/06/2014 GENNERE septembre 2004 Contrat Europe – ASIE

87 SBIM - 06/06/2014 SIMS-REIN Décembre 2004 Communiquer

88 SBIM - 06/06/2014 communiquer

89 SBIM - 06/06/2014 "lévaluation des besoins de prise en charge des insuffisants rénaux chroniques au stade terminal : étude de faisabilité de différents scénarios de recueil dinformations pour répondre aux besoins prioritaires de lAdministration de la Santé, des cliniciens et des chercheurs". B. Stengel, P. Landais Rapport DGS INSERM 1997

90 SBIM - 06/06/2014

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93 Néphrologie JOURNAL DE LA SOCIÉTÉ DE NÉPHROLOGIE Vol. 20 N°

94 SBIM - 06/06/2014 B. Kouchner : Insuffisance rénale chronique : vers une politique de santé publique J. Chanard : Linsuffisance rénale terminale en France La situation de linsuffisance rénale chronique en France P. Landais : Épidémiologie de la demande de soins P. Landais : Offre de soins et prévention 2 février 2002 / 31 / n°4 - pp

95 SBIM - 06/06/2014 Comptes rendus Biologies Académie Sciences 2002 ISSN : Volume Numéro 4 - pp: : un système d'information multi-sources pour l'insuffisance rénale terminale Paul Landais, Ana Simonet, Didier Guillon, Christian Jacquelinet, Mohamed Ben Saïd, Claude Mugnier, Michel Simonet.

96 SBIM - 06/06/2014 A Multi-Source Information System for End-Stage Renal disease D. Guillon & P. Landais for the SIMS-REIN WG E R A - E D T A R e g i s t r y meeting

97 SBIM - 06/06/2014 A dynamic Web application within an n-tier architecture: a Multi-Source Information System for end-stage renal disease. Ben Said M, Simonet A, Guillon D, Jacquelinet C, Gaspoz F, Dufour E, Mugnier C, Jais JP, Simonet M, Landais P. Stud Health Technol Inform. 2003;95:

98 SBIM - 06/06/2014 Systèmes d'information de santé (Ingénierie des systèmes d'information-RSTI série ISI Vol.8 N° 1/2003) Un entrepôt de données pour laide à la décision sanitaire en néphrologie A.Simonet, M. Simonet, F. Gaspoz, M.Ben Saïd, D. Guillon, C. Jacquelinet, C. Mugnier, J-P. Jais, P. Landais

99 SBIM - 06/06/2014 Ontology and Geographical Information System for End-Stage Renal Disease: the SIGNe Michel Simonet, Laurent Toubiana, Ana Simonet, Mohamed Ben Saïd, Paul Landais. Workshop on fundamental issues on geographic and spatial ontologies, COSIT03 Conference on Spatial Information Theory Ittingen, Switzerland 23 sept

100 SBIM - 06/06/2014 Avoiding doubles in distributed nominative medical databases: optimization of the needleman and wunsch algorithm. Mugnier C, Ben Said M, Le Mignot L, Jais J, Le Bihan C, Landais P. Medinfo. 2004;2004(CD) PMID: [PubMed - in process]

101 SBIM - 06/06/2014 GIS INTEGRATION IN NEPHROLOGY: A SIGNE J. Richard, L. Toubiana, M. Ben Said, L. Mignot, JP. Jais, C. Mugnier, P. Landais. RELIABILITY OF PATIENT IDENTIFICATION IN A MULTISOURCE WEB DATABASE L. Le Mignot, C. Mugnier, M. Said, JP. Jais, J. Richard, C. Le Bihan, P. Landais. MULTI-SOURCES INFORMATION SYSTEM AND EPIDEMIOLOGICAL FOLLOW UP OF CHRONIC DISEASE M. Ben Said, C. Mugnier, L. Le Mignot, J. Richard, JP. Jais, P. Landais. Journal of Epidemiology & Community Health Vol 58 Supplement 1 August 2004

102 SBIM - 06/06/2014 Réseau Epidémiologie et Information en Néphrologie (REIN). Résultats du contrôle de qualité du réseau REIN en Languedoc-Roussillon Duny Y., Landais P., Ben Saïd M., De Cornelissen, F. Marty L., Daurès J.P. Contrôle dexhaustivité et de qualité de lenquête Épidémiologique REIN dans une des régions de létude : le Limousin Glaudet F., Aldigier J.C., Lebeau F., Preux P.M., Vergnenegre A. Volume 52 No Hors-série 1

103 SBIM - 06/06/2014 Projet SIGNe : Intégration dun système dinformation géographique pour la néphrologie Richard J.B., Toubiana L., Ben Said M., Le Mignot L., Jais J.P., Mugnier C., Landais P. Dédoublonnage didentité dans des bases web-dynamiques multi-sources Le Mignot L., Mugnier C., Ben Said M., Jais J.P., Richard JB., Le Bihan C., Landais P. Système dinformation multi-source et suivi épidémiologique des maladies chroniques Ben Saïd M., Mugnier C., Le Mignot L., Richard J.B., Jais J.P., Landais P. Volume 52 No Hors-série 1

104 SBIM - 06/06/2014 Genericity of an Epidemiological Network for Nephrology and Rheumatology A Simonet, M Simonet, CG Bassolet, S Ferriol, C. Gueydan, R Patriarche, HJ Yu, P Hao, Y Liu, W Zhang, N Chen, M Forêt, P Gaudin, M. Ben Saïd, D Guillon, P Landais. IDEAS'04-DH Beijing Sept, Workshop On Medical Information Systems The Digital Hospital

105 SBIM - 06/06/2014 GENNERE: a Generic Epidemiological Network for Nephrology and Rheumatology A Simonet, M Simonet, CG Bassolet, S Ferriol, C Gueydan, R Patriarche, H Yu, P Hao, Y Liu, W Zhang, N Chen, M Forêt, P Gaudin, G De Moor, G Thienpont, M Ben Saïd, P Landais, D Guillon. SHANGHAI 8-12 novembre 2004

106 SBIM - 06/06/2014 Geographical Information System For End Stage Renal Disease: SIGNe, an Aid to Public Health Decision making. Toubiana L, Richard JB, Landais P.

107 SBIM - 06/06/2014


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