Boulotte Nadine, Mathot Célia, Saubiez Guillemette

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1 Boulotte Nadine, Mathot Célia, Saubiez Guillemette
THE RECRUITMENT SWEEPSTAKES HAS MANY WINNERS: GENETIC EVIDENCE FROM THE SEA URCHIN STRONGYLOCENTROTUS PURPURATUS Flowers et al © Jeff Goddard Boulotte Nadine, Mathot Célia, Saubiez Guillemette BEM FLUC Master 1 BEM

2 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Sweepstakes : - Loterie Gagnants à chaque saison de reproduction - Balayage aléatoire D’après D’après Sélection : allèles + ou - représentés à la génération suivante Fluctuations aléatoires des fréquences alléliques Même probabilité de transmettre des gènes mais variance et stochasticité dérive génétique

3 Introduction Introduction Côte Ouest de l’Amérique du Nord
Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Strongylocentrotus purpuratus Echinoderme Côte Ouest de l’Amérique du Nord Cycle de vie : Nombre élevé de gamètes Libre fécondation Longue phase planctonique Mortalité juvéniles + jeunes oursins importante Stratégie r Grande variance du succès reproducteur ?

4 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Vérifier les hypothèses de loterie du succès reproducteur : La diversité génétique des recrues est-elle < à celle de la population adulte ? Les cohortes sont-elles génétiquement différenciées ? Existe-t-il une variabilité au sein du succès reproducteur ?

5 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion San Francisco Los Angeles Source : Google Earth

6 Nombre d’individus selon les cohortes
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Nombre d’individus selon les cohortes Cohortes N 1996 77 1998 85 1999 70 2000 33 Edmands et al Mar Biol 126: Analyses : Moléculaires : PCR sur ADNmt : ♀ Statistiques : structuration des populations AMOVA différences entre populations ΦST Simulation : loi de Poisson et loi Gamma

7 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Diversité haplotypique des individus Nombre d’haplotypes des individus Diversité haplotypique Nombre d’haplotypes 7

8 Résultats Introduction Matériels et méthodes Discussion et critiques
Conclusion Diversité haplotypique des individus Nombre d’haplotypes des individus Diversité haplotypique Nombre d’haplotypes Diversité haplotypique et nombre d’haplotypes des recrues suivant les années et le nombre d’individus Diversité haplotypique Nombre d’haplotypes Nombre d’haplotypes Diversité haplotypique N Années 8

9 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Différenciation génétique temporelle : Homogénéité génétique entre les années Différenciation génétique spatiale : Entre sites : ΦST < 0, P = ??? Entre régions biogéographiques : ΦST non significatif Pas de structuration 9

10 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Distributions du nombre de progénitures issues de deux simulations Nombre de progénitures Nombre de femelles Nombre de progénitures x 107 Moyenne 9932 Loi Gamma Loi de Poisson

11 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Loterie chez la plupart des espèces marines à phase larvaire planctonique D’après

12 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Différenciation génétique des cohortes de larves de Crassostrea gigas Petits groupes de ♀ d'une population semi-isolée ponte à différents moments tout au long de l'année Changements des fréquences des gènes : - flux de gènes - dérive génétique Li & Hedgecock 1998. Can J Fish Aquat Sci, 55: 1025––1033 12 12

13 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Etude de la structure génétique de l’huître perlière Pinctada magaritifera Différenciation à grande échelle : - Iles Marquises - Tuamotu-Gambier - Société Différenciation à petite échelle : - 3 sites du lagon Takapoto D’après Arnaud-Haond et al Mar Biol, 155: 147–157 Photo : Sarah Lemer

14 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Etude de la variabilité temporelle chez Paracentrotus lividus 5 locus microsatellites 3 cohortes, N-O Méditerranée Taux de variation génétique identique entre adultes et cohortes Pas de différenciation génétique entre les 3 cohortes Calderon et al Mol Ecol, 18: 3036–3049

15 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Critiques générales Publication complexe résultats peu mis en valeur Axée sur la simulation Stratégie d’échantillonnage non uniforme Séquences non référencées (GenBank) ADNmt peu variable utilisation de microsatellites Dérive 4 x plus faible sur ADN nucléaire 1 génération insuffisant pour observer une différenciation 15

16 Discussion et critiques
Introduction Matériels et méthodes Résultats Discussion et critiques Conclusion Loterie : influence sur la diversité génétique lien avec dynamique et évolution des populations Loterie non mise en évidence chez Strongylocentrotus purpuratus Pas de généralisation

17 Merci de votre attention
D’après

18 Bibliographie sélective
Arnaud-Haond S., Vonau V., Rouxel C., Bonhomme F., Prou J., Goyard E. & Boudry P. (2008) Genetic structure at different spatial scales in the pearl oyster (Pinctada margaritifera cumingii) in French Polynesian lagoons: beware of sampling strategy and genetic patchiness. Marine Biology 155: Calderon I., Palacin C. & Turon X. (2009) Microsatellite markers reveal shallow genetic differentiation between cohorts of the common sea urchin Paracentrotus lividus (Lamarck) in northwest Mediterranean. Molecular Ecology 18: Ebert T. A. (2007) Growth and survival of postsettlement sea urchins. Edible Sea Urchins: Biology and Ecology, J. M. Lawrence (eds), Elevier Science B. V. Chap. 6: Ebert T.A., Schroeter S. C., Dixon J. D. & Kalvass P. (1994) Settlement patterns of red and purple sea urchins (Strongylocentrotus franciscanus and S. purpuratus) in California, USA. Marine Ecology Progress Series 111: 41-52 Edmands S., Morberg P.E. & Burton R. S. (1996) Allozyme and mitochondrial DNA evidence of population subdivision in the purple sea urchin Strongylocentrotus purpuratus. Marine Biology 126: Kato S. & Schroeter S. C (1985) Biology of the Red Sea Urchin, Strongylocentrotus franciscanus, and its Fishery in California. Marine Fisheries Review 47: 1-20 Lin G. & Hedgecock D. (1998) Genetic heterogeneity, detected by PCR SSCP, among samples of larval Pacific oysters (Crassostrea gigas) supports the hypothesis of large variance in reproductive success. Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences 55: 1025–10334 McEdward L. R. & Miner B. G. (2007) The Ecology of Strongylocentrotus franciscanus and Strongylocentrotus purpuratus. Edible Sea Urchins: Biology and Ecology, J. M. Lawrence (eds), Elevier Science B. V. Chap. 5: Miller B. A. & Emlet R. B. (1997) Influence of nearshore hydrodynamics on larval abundance and settlement of sea urchins Strongylocentrotus franciscanus and S. purpuratus in the Oregon upwelling zone. Marine Ecology Progress Series 148: 83-94 Moberg P. E. & Burton R. S. (2000) Genetic heterogeneity among adult and recruit red sea urchins Strongylocentrotus franciscanus. Marine Biology 136: Rogers-Bennett L. (2007) The Ecology of Strongylocentrotus franciscanus and Strongylocentrotus purpuratus. Edible Sea Urchins: Biology and Ecology, J. M. Lawrence (eds), Elevier Science B. V. Chap. 19: 18

19 ANNEXES

20 Effet de l’histoire de vie de l’oursin pourpre
Strongylocentrotus purpuratus Durée de la phase larvaire, dispersion, isolement géographique, évènement exceptionnel, front océanique : influencent le recrutement peuvent expliquer les différences de recrutement entre espèces marines Goggiotti & Vetter 1999. Can J Fish Aquat Sci, 56: 1376––1388 20

21 Hétérogénéité génétique entre adultes et recrues de
l’oursin rouge Strongylocentrotus franciscanus Recrues génétiquement différentes des adultes, pour une localité donnée Recrues différentes entre elles, au N de la Californie Hétérogénéité des recrues pourrait être utilisée pour évaluer la dispersion larvaire Moberg & Burton 2000. Mar Biol 136: 773–784 21

22 Etude de la taille effective chez Sciaenops ocellatus (Tambour rouge)
Log Ne/N Modèle minimal Nombre de femelles participant à la reproduction Métapopulation : 1 femelle sur Modèle démographique minimal : 1 femelle sur 17 Métapopulation p Turner et al Gen 162: 1329–1339 22

23 Simulation du succès reproducteur
Loi de Poisson : compter les évènements aléatoires indépendants = calculer les fluctuations associées Loi Gamma : modéliser les processus suivant la loi de Poisson Objectif : la stratégie d’échantillonnage détecte-t-elle de manière significative : 1. les variations du succès reproducteur : 3 populations de 1 000, et 100 000 femelles : 1 épisode de reproduction Permet d’estimer la proportion de femelles gagnantes + nombre de progénitures par femelle 2. les réductions de la diversité génétique chez les recrues : Bootstrap : 80 individus ont été ré-échantillonnés au hasard Diversité haplotypique des recrues avec la loi Gamma et la loi de Poisson. 23

24 Simulation du succès reproducteur : diversité haplotypique
Distributions de la diversité haplotypique des recrues issues du Bootstrap Diversité haplotypique Fréquence absolue 64,8% 5% Loi Gamma Loi de Poisson 24