La présentation est en train de télécharger. S'il vous plaît, attendez

La présentation est en train de télécharger. S'il vous plaît, attendez

Quels examens de biologie moléculaire prescrire et obtenir en 2011? I Rouquette.

Présentations similaires


Présentation au sujet: "Quels examens de biologie moléculaire prescrire et obtenir en 2011? I Rouquette."— Transcription de la présentation:

1 Quels examens de biologie moléculaire prescrire et obtenir en 2011? I Rouquette

2 Elles ont pour vocation de réaliser les tests moléculaires innovants pour lensemble des patients de la région, quel que soit létablissement où ils sont pris en charge, CHU, CLCC, CH ou établissement privé. Plateformes hospitalières de génétique moléculaire des cancers

3 Plateforme de génétique moléculaire des cancers Directeur de plateforme: E Delabesse Trois sites: Rangueil I Rouquette: poumon EGFR/ALK/BRAF/HER2 ICR G Favre PI3K poumon Purpan J Selves Lamant: colon mélanome E Delabesse: BCR ABL/KIT

4 A Rangueil 2005 projet ligue: séquençage de 100 patients acquisition dune expertise formation technicien Tenon 2007 demande dactivité nouvelle: acquisition déquipements et budget fonctionnement sur 2 ans pour commande réactifs 2009 : intégration plateforme biologie moléculaire des cancers du CHU (E Delabesse) 2009 ORPAMIP: Structuration de la biologie moléculaire.(Kras, EGFR, MSI, 1p19q). 2010: Subvention EGFR INCa: pas de facturation clinicien patient, remboursement déstockage 2011: subvention INCa biomarqueurs émergents

5

6 AUJOURDHUI Une AMM première ligne: gefitinib Une ATU: Crizotinib Des essais cliniques plus ou moins avancés Un seul examen aujourdhui indispensable pour guider la conduite thérapeutique: recherche des mutations activatrices dEGFR

7 GEFITINIB (IRESSA®) is indicated for the treatment of adult patients with locally advanced or metastatic non small cell lung cancer (NSCLC) with activating mutations of EGFR.

8 48% 3% 5% 3%

9 2142 adénocarcinomes exon 19 et L858R Incidence of EGFR Exon 19 Deletions and L858R in Tumor Specimens From Men and Cigarette Smokers With Lung Adenocarcinomas Sandra P. DAngelo et al J Clin Oncol 2011

10 Indications Financement INCa: Tous les patients atteints dun adénocarcinome du poumon devraient pouvoir avoir accès au test EGFR pour déterminer le statut mutationnel de leur tumeur. Non acceptés par la plateforme: épidermoïdes du fumeur, NEGC Acceptés après discussion: épidermoïdes du non fumeur, adéno-squameux, CNPC.

11 Pathologiste de la plateforme Pathologiste détenteur du matériel CHG, CHU, Secteur Privé Circuit des examens de biologie moléculaire

12 Contrôle morphologique Extraction dADN PCR Criblage Séquençage des variants

13 BILAN EGFR 2010 Trimestre 1Trimestre 2Trimestre 3Trimestre 4 Nb patients Nb examens % mutations17,0512,179,5711,56 Délai de rendu15 jours 11 jours9 jours % Prescriptions secteur privé 37,526,9645,2251,02 % Non interprétables 2,2713,916,964,08

14 PATIENTS TESTES Trois premiers trimestres % MUTES23%9,5 à 17%7 à 11%

15

16 % 12-14% 5% une altération moléculaire peut être identifiée chez environ 40 % des patients atteints dun cancer du poumon non à petites cellules.

17

18

19 % Progression Stabilité Réponse partielle confirmée Réponse complète confirmée Variation maximale de la taille tumorale (%) Activité de linhibiteur oral de ALK, le PF , dans une population de CBNPC positifs pour ALK (n = 82) 81 Translocation EML4-ALK Taux de réponse = 57% Contrôle à 8 semaines : 87 % SSP à 6 mois : 72 % Kwak, NEJM 2010

20 20 Protéine de fusion EML4-ALK: partie N-term. EML4 (echinoderm michrotubule associated protein like 4) + portion intracellulaire du récepteur tyrosine- kinase ALK (anaplastic lymphoma kinase) inversion du bras court du chromosome 2 [Inv(2)(p21p23)] qui fait joindre exons 1–13 de EML4 aux exons 20–29 de ALK.

21 Split signal en FISH FISH: examen de biologie moléculaire: Problèmes: Fixateur Echantillonnage Eosine Equipement spécifique Aide à la lecture On nidentifie que la cassure dALK

22 Clin Cancer Res 2010 D5F3 or D9E4 antibodies Journal of Thoracic Oncology 2011 ALK1+ système de révélation J Clin Pathol 2010 ALK 5A4

23

24 Bilan ALK 2011 Trimestre 1Trimestre 2Trimestre 3Trimestre 4 (Octobre) Nb patients Nb examens % Translocations 20%6,4%1,8%4,2% Délai de rendu 15 jours 12 jours 11 jours % Prescriptions secteur privé 20%20,3%24,1%14,8% % Non interprétables 0%16,1%1,8%4,2%

25 Mutations de K-Ras Mutations activatrices en position 12,13 or 61 Mutuellement exclusives avec celles d EGFR Associ é es au tabac (transv. G en T ou C) 22% des ADC ( tr è s rares ds malpighiens) Mais chez 15% des non fumeurs (transition G en A) GGTGGCGCACCA Exon 1 Codon 12 Glycin Codon 13 Codon 59Codon 61 TGT CystinCGT Arginine GTT ValineAGT Serine GAT AspartateGCT Alanine

26 Marchetti et al J Clin Oncol ,046 NSCLCs BRAF mutations were present in 36 ADCs (4.9%) and one SCC (0.3%). Twenty-one of the mutations (56.8%) were V600E, and 16 (43.2%) were non-V600E. Paik et al J Clin Oncol 2011 BRAF mutations occur in 3% of patients with lung adenocarcinoma and occur more commonly in current and former smokers BRAF

27 BRAF mutations occur in approximately 5% of pulmonary adenocarcinomas, often with a papillary architecture, but in the micropapillary subgroup, the incidence rises to approximately 20%, similar to that seen in thyroid and ovarian papillary adenocarcinoma. Yousem et al The histopathology of BRAF-V600E- mutated lung adenocarcinoma. Am J Surg Pathol Rosane De Oliveira et al Micropapillary Lung AdenocarcinomaEGFR, K-ras, and BRAF Mutational Profile Am J Clin Pathol 2009

28 Shigematsu Cancer Res 2005; HER2 mutations were present in 1.6% (11 of 671) of NSCLC Pao Lancet Oncol 2011 HER2 mutations are present in 2% of NSCLC

29 PIK3CA PIK3CA Mutations and Copy Number Gains in Human Lung Cancer Cancer Res 2008;68(17):6913–21] 1,6% de mutations. PIK3CA copy number gains occur at much higher frequencies in lung cancers than do activating mutations and the gains target squamous cell carcinomas. IGR Essai précoce: GDC-0941, inhibiteur de la protéine PI3 kinase

30 Autres biomarqueurs TECHNIQUENB TOTAL + % MUT 2010 NB TOTAL + % MUT 2011 KRASHRM/SEQ201 20% ,9% BRAFPCR-ASO ,7% HER2HRM/SEQ ,5% PI3K (ICR)SEQ %

31 Améliorations Techniques EGFR: Passage techniques plus rapides et sensibles, redesign des amorces, sensibilisation fixateur: moins de prélèvements non interprétables, délais raccourcis FISH ALK: criblage IHC systématique corrections éosine acidité, contrôle externalisé des cas litigieux

32 EXON 19EXON 21EXON 18EXON 20 Mutation recherchée DELETIONSMUTATIONS PONCTUELLES MUTATIONS PONCTUELLES T790M INSERTIONS Techniques utilisées HRM/ ANALYSE DE FRAGMENT PCR-ASOHRM/ SEQUENCAGE PCRASO/ SEQUENCAGE

33 Améliorations gestion Interface cliniciens/plateforme: Mélanie Boussard Fiche modifiée téléchargeable Développements informatiques pour recueil de données et rendu résultats (fiches complémentaires)

34

35

36

37

38 BILAN EGFR 2011 Trimestre 1Trimestre 2Trimestre 3Trimestre 4 (Octobre) Nb patients Nb examens % mutations5,9%9,7%13,6%6,45% Délai de rendu 8 jours 5 jours % Prescriptions secteur privé 44%37,5%35,3%44,1% % Non interprétables 4,2%1,6%2,5%0%

39 TRIM 1TRIM 2TRIM 3TRIM 4 TOTAL FUMEUR NON FUMEUR ANCIEN FUMEUR NON RENSEIGNE HOMME FEMME NON RENSEIGNE35100 TRIM 1TRIM 2TRIM 3TRIM 4 TOTAL FUMEUR NON FUMEUR ANCIEN FUMEUR NON RENSEIGNE 878 HOMME FEMME NON RENSEIGNE 000 ANNEE 2010 ANNEE 2011

40 Evolution du tabagisme et du nombre de femme/homme (en %)

41 Aujourdhui Un dossier enregistré le vendredi Résultats exon 19/21/20 IHC ALK le mercredi Résultats KRAS BRAF HER2 le vendredi Si demande PI3K transfert ICR si matériel restant

42 Délais Délai de rendu des résultats (en jours) TRIM 1TRIM 2TRIM 3TRIM Délai dacheminement de la demande entre le prescripteur et le laboratoire de biologie moléculaire (en jours) TRIM 1TRIM 2TRIM 3TRIM

43 Augmentation du nombre de dossiers pour les différentes analyses depuis le début de lactivité

44 Les non conformités les plus retrouvées Fiches de prescription directement envoyée au laboratoire de biologie moléculaire sans prélèvement Le stade TNM de la maladie nest pas indiqué ou ne correspond pas aux indications précisées pour la prescription de lanalyse Le statut tabagique nest pas renseigné La date de prélèvement nest pas renseignée Le fixateur nest pas renseigné Le numéro du prélèvement inscrit sur la fiche de prescription est absent ou ne correspond pas au numéro du bloc La congélation du prélèvement nest pas indiquée 1 dossier de prescription sur 3 nest pas conforme… Ce qui entraine: -Un retard de traitement et donc un retard de rendu des résultats -Une perte de temps pour lingénieur qui doit rappeler les prescripteurs/anatomopathologiste -Un défaut dans les statistiques rendus à lINCA

45 Reste à améliorer Délai d acheminement Délai de réponse (protéinase K, DCC) Évolution continue des techniques Renseignements cliniques Projet IFCT de recueil des données

46 Le futur sur la plateforme Prescrire via le DCC ONCOMIP (Suivi, rendu des résultats) Améliorer la détection des anomalies les plus utiles (plateforme aide lecture FISH, MAD pyroséquenceur) Participer aux études nationales et aux STIC Développer lIHC Développer la détection de nouveaux biomarqueurs (amplification c-met, FGFR…) Exploitation des données recueillies projet IFCT

47

48 Le futur ALK: algorithme IHC/FISH EGFR: place des anticorps? Marqueurs prédictifs de réponse (TS..): IHC Etudes multicentriques de validation, STIC


Télécharger ppt "Quels examens de biologie moléculaire prescrire et obtenir en 2011? I Rouquette."

Présentations similaires


Annonces Google