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Chêne pédonculé (Quercus robur) et chêne sessile (Quercus petraea): deux espèces coexistant au sein de peuplements forestiers européens mixtes, et présentant.

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Présentation au sujet: "Chêne pédonculé (Quercus robur) et chêne sessile (Quercus petraea): deux espèces coexistant au sein de peuplements forestiers européens mixtes, et présentant."— Transcription de la présentation:

1 Chêne pédonculé (Quercus robur) et chêne sessile (Quercus petraea): deux espèces coexistant au sein de peuplements forestiers européens mixtes, et présentant des différences morphologiques et écologiques (Kremer & al., 2002). Or, hybridation naturelle possible entre ces deux espèces, et différenciation moléculaire interspécifique très faible (environ 3%) (Mariette & al., 2002). Cependant, présence de régions du génôme très différenciées (« points chauds de différenciation ») (Scotti-Saintagne & al., 2002) existence de « gènes de spéciation »? (Wu & al., 2004) Objectifs: étude de la diversité et de la différenciation génétique et écologique entre ces deux espèces Focalisation sur les gènes potentiellement impliqués dans les systèmes de compatibilité de croisement Génétique et évolution des systèmes de compatibilité de croisement dans le complexe despèces chêne sessile - chêne pédonculé ABADIE Pierre 1, ROUSSEL Guy 1, MARTINEZ-PRIETO Carolina 1, KREMER Antoine 1 et GARNIER-GERE Pauline 1 1 : UMR 1202 BIOGECO – INRA Bordeaux, Equipe de Génétique, 69 route d'Arcachon, CESTAS, France : : Introduction - Objectifs : Pédigrée, 30 chênes pédonculés contrastés,10 génotypes x 3 clones/génotype : Récolte et mélange de pollen de 4 chênes sessiles Prélèvements de fleurs sur les arbres mères des croisements contrôlés, 15 jours et 1 mois après injection du pollen 2. Compatibilité dhybridation entre génotypes - Cytologie 1. Compatibilité dhybridation entre génotypes - Croisements contrôlés 3. Diversité et différenciation intra/interspécifique - Génétique des populations Empochage des arbres mères et injection du mélange de pollen Evaluation de la compatibilité dhybridation en fonction de larbre mère pédonculé et du pollen sessile utilisé Génotypage SSR des glands hybrides produits Mesures de la fructification des arbres mères floraison, avortements, glandée vérification de lhybridation % génotypes / génotype Coloration des grains de pollen et des tubes polliniques en croissance au bleu daniline Microscopie à fluorescence UV Evaluation de la compatibilité dhybridation pré-zygotique en fonction de larbre mère pédonculé Mesurer le nombre, la longueur, la vitesse de croissance des tubes polliniques dans les stigmates Sélection de 19 gènes candidats au contrôle de la compatibilité de croisement interspécifique à partir dESTs aux fonctions connues chez Arabidopsis thaliana: interaction pollen-pistil (POP2,..), guidage du tube pollinique (HAP2, …), croissance du tube (TUB8), Interaction pollen-ovule (FER, …) (Palanivelu & al., 2003, Huck & al., 2003) Extraction dADN des 2 espèces de chênes (pédonculé et sessile), issues de 3 populations mixtes contrastées: Cuves (52), Petite Charnie (53), Laveyron (40) Individu 1 Individu 2 SNP Hz Indel Exemple de polymorphismes alléliques à partir de chromatogrammes EchantillonsExpérimentationsAnalyses EchantillonsPréparation Echantillonnage des gènes Séquençage Séquençage diploïde de fragments des gènes et détection de polymorphismes: SNP (Single Nucleotide Polymorphism), Indels, microsatellites Résultats préliminaires Réalisation de croisements contrôlés sur un plus grand nombre dindividus Estimation des flux de gènes interspécifiques (logiciel IM) Perspectives: Tests décarts à la neutralité sélective, basés sur le Fst et les patrons de diversité Identification quelques SNPs polymorphes très différenciés (>30%, différenciation moyenne entre ces espèces ~3% pour des marqueurs neutres) Excès dallèles rares pour le gène Tub8 D de Tajima <0 et significatif GèneEspèce Longueur séquencée Longueur analysée Nombre séquences Sites polymorphes θπθs Fst moyen D Tajima Pop2 Qr 900pb794pb % -1,03 Qp ,84 Tub8 Qr 1200pb1075pb % -2,23*** Qp ,33*** Analyses A tester avec un plus grand nombre de séquences Remerciements: Projet TRANSBIODIV (ANR-06-BDIV )


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