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Marqueurs moléculaires pour les études génétiques et taxonomiques chez les végétaux.

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Présentation au sujet: "Marqueurs moléculaires pour les études génétiques et taxonomiques chez les végétaux."— Transcription de la présentation:

1 Marqueurs moléculaires pour les études génétiques et taxonomiques chez les végétaux

2 Spécificité des études génétiques chez les plantes Hermaphrodisme (fréquent) Clonage possible (bouturage, greffage, in vitro, etc…) Croisements interspécifiques fréquents Systèmes dauto-incompatibilité Dispersion du pollen, flux de gènes sauvage/cultivé Chez les plantes pérennes (arbre, vigne) Longueur des périodes juvéniles, des générations, des programmes dhybridation

3 Identification variétale à laide de microsatellites chez les pêchers et les cerisiers

4 Etude du polymorphisme et calcul du pouvoir discriminant PD No. dalleles PD No. dalleles PD No. dalleles PD BPPCT 001 BPPCT 002 BPPCT 004 BPPCT 005 BPPCT 006 BPPCT 007 BPPCT 008 BPPCT 009 BPPCT 010 BPPCT 011 BPPCT 012 BPPCT 013 BPPCT 014 BPPCT 015 BPPCT 016 BPPCT 017 BPPCT 018 BPPCT 019 BPPCT 020 BPPCT 021 BPPCT 022 BPPCT 023 BPPCT 024 BPPCT 025 BPPCT 026 BPPCT 027 BPPCT 028 BPPCT 001 BPPCT 004 BPPCT 007 BPPCT 011 BPPCT 015 BPPCT 018 BPPCT 019 BPPCT 022 BPPCT 025 BPPCT 026 BPPCT m.p N m.p. 2 N 4 3 N 1 1 N 1 N 1 N N N 4 3 N 1 1 N 1 N 1 N N N N N - N N N N N N - N N Pêcher Cerisier No. dalleles

5 BPPCT 028 Pêcher Prunier Myrobolan MerisierCerisier Amandier x pêcher

6 (UDP96018) (UDP98022) (UDP98406) (UDP98410) (UDP98416) (UDP96010) (UDP98415) (UDP96015) (PS12e2) Carte de référence Prunus : Amandier Texas x pêcher Earlygold Cartographie des microsatellites

7 Résultats : Pêcher

8 UDP CPPCT BPPCT UDP BPPCT CPPCT BPPCT CPPCT BPPCT BPPCT BPPCT UDP CPPCT UDP UDP Nbr d'allelePDchr BPPCT Total BPPCT 4 CPPCT 5 UDP Sélection des microsatellites pour le pêcher

9 283 variétés (12 variétés en commun : INRA, Ctifl, IRTA) - 4 variétés de référence ( Redhaven, Fantasia, Snow Queen,Julie ) - 3 prélèvements sur le même arbre pour 3 variétés - 2 arbres différents pour 3 variétés Résultats : Pêcher Résultats sur 68 variétés analysées avec les 16 microsatellites (111 allèles) toutes distinguées avec seulement 6 microsatellites (46 allèles) BPPCT001, BPPCT015, BPPCT017, BPPCT025 UDP98025, UDP98407

10 BPPCT025 BPPCT001 Pêchers

11 Pratt's Compact Redhaven Bradember Summergrand Zairupe Andrus Esja Fantasia Flavortop Ferjalou Fuzador Harko Valandine Clio Redhaven Snow Queen Anita Zainara Minastar Nectared 9 RoyalGold Julie Zaifer Babiole Fairhaven Michelini Summergold 783 Flavorcrest Ferradine Harbrite Harken Grabelle Redtop Maygold Sibelle Symphonie Sundance Desertgold Nectarine Cerise Semis de roussanne Millecoton de la toussaint Tardive du mont dor Klamt Merriam Baladin Madame Guilloux Sanguine vineuse Belle impériale Incomparable Guilloux Madame Gired Senateur Cazeneuve Charles Roux Madeleine Blanche Galande Belle de Montelimar Angevine rouge Royale de Barsac Tardive valla Colomba Robin Genadix 7 Amsden Meystar Esgin Sensation Granbo Babygold 5 Nemared Coefficient de similarité PECHERS 16 microsatellites 111 allèles Nei UPGMA Brugnon jaune Pavie jaune Pêche blanche Pêche jaune Pêche rouge Nectarine blanche Nectarine jaune

12 obtenus à partir des 283 variétés, analysées avec les 6 microsatellites distinguant les 68 variétés : BPPCT-001, -015, -017, -025 ; UDP98-025, -407 Résultats Mêmes profils obtenus pour les 12 variétés analysées indépendamment à lINRA et au Ctifl 268 (95%) sont distinguées les unes des autres Mutants distingués: Redhaven, Compact Redhaven et Clio 15 variétés non distinguées: 6 groupes de 2, 1 groupe de 3 et un groupe de 5 Mutants non distingués: -Royal Gold, Springtime -Summer Lady, Mercil O. Henry, Snow Queen

13 Analyse des 6 microsatellites sur lensemble des variétés Discrimination des variétés non distinguées par des microsatellites supplémentaires p armi les 10 microsatellites sélectionnés restant Jusquà leur distinction Base de données Microsatellite 1Microsatellite n Variété 1Taille allèle 1 Taille allèle 2 Taille allele1 Taille allele2 Variété 2Taille allèle 1 Taille allèle 2 Taille allele1 Taille allele2 Variété nTaille allèle 1 Taille allele 2 Taille allele1 Taille allele2 Résultats Mise en place dune stratégie pour lidentification des variétés de Pêcher


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