Cartographie génomes entiers

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1 Cartographie génomes entiers
Page 24 1980, David Botstein Variations de l’ADN (PTFR) → point de départ pour cartographier en détails l’ensemble du génome humain 1990: lancement du projet Génome Humain Buts: Cartographier tout le génome Déterminer la séquence nucléotidique de tous les chromosomes

2 Projet Génome Humain 3 étapes
Page 24 3 étapes La cartographie génétique (marqueurs génétiques) La cartographie physique (distances entre les marqueurs / nucléotides) Le séquençage de l’ADN

3 Projet Génome Humain Cartographier le génome d’autres espèces:
2004 / 2007 Page 24 Cartographier le génome d’autres espèces: Saccharomyces cerevisiae (une levure) E.Coli et d’autres procaryotes Caenorhabditis elegans (un Nématode ou Ver rond) Drosophila melanogaster (la Mouche du vinaigre) Mus musculus (la Souris commune) 1996 1997 1998 2000 2002

4 Séquençage d’ADN = séquence nucléotidique complète Technique utilisée:
Page 25 = séquence nucléotidique complète Technique utilisée: Clonage de fragments d’ADN Marquage d’ADN Synthèse d’ADN (nucléotides particuliers) Electrophorèse sur gel Méthode de Sanger

5 Méthode de Sanger Grand nombre de copies d’un fragment d’ADN purifié
Page 25 Grand nombre de copies d’un fragment d’ADN purifié

6 Méthode de Sanger (étape n°1)
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7 Méthode de Sanger (étape n°2)
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8 Méthode de Sanger (étape n°3)
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9 Méthode de Sanger (étape n°4)
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10 Consortium public (méthode)
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11 Autres stratégies de séquençage
Page 26 1992, J. Craig Venter

12 Indices fournis par les séquences du génome
Page 27 La génomique (étude des génomes – séquence ADN) → réponses aux questions sur: La structure des génomes La régulation de l’expression génique Le développement et la croissance L’évolution

13 Intérêt des biotechs… Pages Etudier les gènes directement sans déduire un génotype à partir d’un phénotype Le problème est inversé… Il faut maintenant déduire le phénotype à partir d’un génotype Comment peut-on reconnaître les gènes et déterminer leur fonction en partant d’une longue séquence d’ADN ?

14 Analyse des séquences d’ADN
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15 Etude l’expression génique
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16 Etude l’expression génique
Page 29 Etape n°1

17 Etude l’expression génique
Page 29 Etape n°2

18 Etude l’expression génique
Page 29 Etape n°3

19 Etude l’expression génique
Page 29 Etape n°4

20 Etude l’expression génique
Page 29 Résultat: