Microbiologie Clinique

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1 Microbiologie Clinique
LE DIAGNOSTIC

2 Buts Établir et confirmer l’étiologie (les caractéristiques) de l’agent infectieux par son l’isolation et son identification Faire des tests de susceptibilité aux agents antimicrobiens Faire des tests sérologiques pour faire un suivi de la progression de l’agent infectieux chez le patient Ex. Suivi de la réponse immune

3 1. Le Prélèvement Prélèvement doit représenter la zone malade
Quantité prélevée doit permettre un examen complet Doit éviter la contamination Flore naturelle Doit être acheminé rapidement au laboratoire Maintenir la représentation Si possible, faire avant l’antibiothérapie Déterminer la susceptibilité avant de prescrire l’antibiothérapie

4 2. Identification Préliminaire
Microscopie Coloration de Gram Coloration alcoolo acido-résistante Culture Milieu sélectif et/ou enrichissant Milieux différentiels Ex. Patrons d’hémolyses

5 3. Suivi Méthodes Microbiologiques Sérologique/immunologique ELISA
Agglutination Fixation du complément

6 Méthodes Sérologiques/Immunologiques
Déterminer la présence d’un antigène : Un organisme Une protéine Une toxine Un anticorps Réaction au latex (agglutination) Dosage par la méthode d’ELISA Fixation du complément

7 Agglutination au Latex
Test d’antigène + Latex enrobé d’anticorps Spécimen qui contient l’antigène Test d’anticorps Latex enrobé d’antigène Spécimen qui contient des anticorps + 7 7

8 Fixation du Complément
Méthode Ajout d’Ac contre Ag à être décelé Ajout d’une concentration limite du complément Ajout de globules rouges sensibilisés avec IgG Sérum du patient Avec Ag Pas d’Ag Lyse Y Y Ag

9 Fixation du Complément (Suite)
Essai qui détermine si le complément est utilisé par la liaison d’AC spécifique à un antigène Complément utilisé – Pas de lyse de globules rouges Fixation du complément Antigène présent Complément inutilisé-lyse de globules rouges Aucune fixation du complément Antigène absent Essai peut être fait de façon quantitative Sensibilité moyenne

10 Dosage par la Méthode ELISA
Utilisé pour déceler la présence d’anticorps ou d’antigènes Très sensible Quantitatif Rapide

11 ELISA – Détection d’Antigène
Sérum (source d’Ag) est ajouté à puits de plastic Agent bloquant est ajouté Ac (anticorps primaire) contre Ag est ajouté Lavage Ac (secondaire) complexé à une enzyme est dirigé contre l’anticorps primaire. Cela va permettre la détection Lavage Substrat est ajouté Antigène Présent Antigène Absent Y Y ENZ Y ENZ Y

12 ELISA – Détection d’Anticorps
Ag cible pour Ac à déceler ajouté aux puits Agent bloquant est ajouté Sérum à tester est ajouté Lavage Ac (anticorps primaire) contre Ag est ajouté, ensuite on fait un lavage Ac (secondaire) complexé à une enzyme est dirigé contre l’anticorps primaire. Cela va permettre la détection On fait un lavage, puis le substrat est ajouté Ac Présent Ac Absent Y Y ENZ Y ENZ Y

13 Interprétation des Résultats
Sérums de patients testés pour le VIH Ac 1o anti-VIH de souris Ac 2o anti-Ac de souris Sérum 1 Sérum 2 Sérum 3 Témoin négatif Dilutions des sérums Conclusions Patients 1 & 3 sont positif pour le VIH Patient 3 possède un titre plus élevé Patient 2 est négatif pour le VIH

14 Suivi du Microorganisme
Méthodes Microbiologiques Comptes viables Comptes directs Sérologique/immunologique ELISA Agglutination

15 ÉPIDÉMIOLOGIE

16 Définitions Épidémiologie: Branche de la médecine qui décrit l’occurrence, la distribution et les types de maladies dans des populations pendant des périodes de temps distinctes L’épidémiologie est l’étude du qui, quoi, quand, où et comment des poussées de maladies infectieuses

17 Définitions (Suite) Maladie infectieuse Maladie subclinique
Maladie causée par un agent infectieux Ex. le tetanos Maladie subclinique État dans lequel l'infection a causé une atteinte tissulaire, mais avec absence de signes ou symptômes cliniques Maladie contagieuse Transmission directe ou indirecte à partir d’une personne infectée Ex. L’influenza – La grippe Maladie transmissible Transmission par des voies non naturelles à partir d’une personne infectée Ex. le SIDA, la rage

18 Mesures de l’Apparition de la Maladie
Incidence cumulative Proportion de personne dans une population qui est tombée malade au cours d’une période de temps spécifiée No de nouveaux cas de la maladie durant la période de temps spécifiée IC= No totale de personnes à risque dans la population au début de la période de l’étude

19 Incidence Cumulative: Exemple 1
L'incidence quotidienne de la varicelle chez les enfants de 1ère année à l’école primaire Booral pendant l'épidémie de 1998 était de 10 nouveaux cas pour 100 enfants S'il y avait 200 enfants en première année, combien de nouveaux cas y avait-il chaque jour? 10 nouveaux cas enfants X nouveaux cas enfants X = 20, donc 20 enfants

20 Incidence Cumulative: Exemple 2
En 2000, 818 femmes avaient une fécondation in vitro à Ottawa. 80 d’entre elles ont développé une grossesse clinique dans le mois qui a suivi Le IC de la grossesse était? IC= 80/818 = 0.098 0.098 x 100 = 9.8 %; donc 9,8 cas par centaines de femmes

21 Morbidité: Taux d’Attaque
Taux de propagation d’une maladie d’un individu à un autre dans une fraction de la population qui est observée pendant une période limitée de temps Mesure du risque de développer la maladie durant une période de temps précise Mesure de la transmissibilité No de nouveau cas de la maladie durant la période de temps spécifiée Taux d’attaque= Population totale à risque durant la période de temps

22 Taux d’Attaque: Exemple
Pendant la première semaine d‘avril 2002, l‘unité de la santé publique a été appelée pour mener une enquête sur plus de 20 rapports de personnes souffrant de gastro-entérite après avoir mangé au restaurant le Parramatta. Une enquête a été menée et tous les clients qui ont mangé au restaurant durant cette semaine ont été interviewés. Ils ont trouvé 2000 clients qui ont mangé au restaurant, dont 400 qui sont tombés malades Quel était le taux d'attaque? Taux d'attaque = 400/2000 = 0.2 = 0.2 x 100 =20% donc 20 personnes par 100 clients