Licence professionnelle de Génomique

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1 Licence professionnelle de Génomique
Année 2012 – 2013 Transposons : des gènes anarchiques ? Article publié par Dominique Anxolabéhère et al. Pour la science N°351 – Janvier 2007 Olivier SAULNIER

2 Un transposon ? Élément transposable (« Jumping gene ») séquence d’ADN « mobile » capable de se déplacer d’une position à l’autre du génome. Présent chez tous les organismes vivants. ≈ 0,5 – 7kb Code pour plusieurs protéines

3 Barbara McClintock 1902 – 1992 (USA)
Cold Spring Harbor (1948) Phénomène d’instabilité dans le génome Éléments mobiles : Ds (dissociation) & Ac (activateur) Prix Nobel de médecine (1983)

4 Classification Classe I => rétrotransposons
=> transposition via de l’ARN => transcriptase-inverse => mode réplicatif => « copier / coller » Classe II => transposons à ADN => transposase => mode non-réplicatif => « couper / coller » Classe ? => MITEs (Miniature Inverted-repeat Transposable Elements) => « non-autonome » => pas d’enzymes pour la transposition

5 Répartition - 17% du génome d’Arabidopsis thaliana
- 45 % du génome de Homo Sapiens - Plus de 50 % du génome de Zea maïs Transposons: The Jumping Genes, Leslie A. Pray et al., Nature, 2008. Sc: Saccharomyces cerevisiae; Sp: Schizosaccharomyces pombe; Hs: Homo sapiens; Mm: Mus musculus; Os: Oryza sativa; Ce: Caenorhabditis elegans; Dm: Drosophila melanogaster;….

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7 Mode d’action site cible transposase transposon Inverted repeat
The Nature of Transposons Chapter 11 pp transposon site cible Inverted repeat ADN pol I ligase transposase flanking sequence The Nature of Transposons Chapter 11 pp

8 Conséquences gènes pertubés => région codante => promoteur
=> séquences régulatrices => encombrement spatial avantages sélectifs => domaine de fixation à l’ADN (nouveaux facteurs de transcription) => protéines « hétérologues » Chez la drosophile => insertion transposon copia dans le 2ème intron du gène white perturbe la transcription et provoque l’apparition d’yeux orange Chez la souris => insertion d'un rétrotransposonIAP dans un exon du gène Agouti. Il dérégule l'expression de la protéine ce qui conduit à des souris à poil jaune.

9 Conclusion provoque de nombreuses mutations (maladies génétiques mais le plus souvent silencieuses..) responsable de l’augmentation de la taille des génomes outils moléculaire : mutagénèse, vecteur de transfert de gènes favorisation d’hétérochromatine par les transposons ? héro ? Nombreux transposons aux niveaux des télomères

10 Merci pour votre attention