Travail de génétique 2e doctorat

Présentation au sujet: "Travail de génétique 2e doctorat"— Transcription de la présentation:

1 Travail de génétique 2e doctorat
Bensa Natacha Bernier Séverine Lievrouw Mélanie Maréchal Christelle Année académique

2 Paramètres génétiques et effets environnementaux caractérisant la capacité à la défense des Bergers Belges

3 1. Objectifs Evaluer l’héritabilité de la capacité à la défense chez les Bergers belges Calculer la corrélation génétique entre les traits et les facteurs d’environnement

4 2. Matériels A. Animaux 2427 Bergers belges2168 mâles 259 femelles
530 pères : 4,29 descendants compétiteurs en moyenne 298 des pères font également des compétitions 866 mères: 2,64 descendants compétiteurs en moyenne 85 des mères font également des compétitions

5 2.A. Animaux (suite) 3 variétés de Bergers Belges: 2208 Malinois
193 Tervuren 26 Groenendael Age : 1 à 10 ans

6 2. Matériels B. Compétition
15772 résultats venant de 2196 compétitions En France De 1986 à 1996 : 93% des compétitions ont eu lieu entre 1990 et 1994

7 Compétition : 6 à 19 tests différents avec 5 niveaux de difficultés

8 2.B. Matériels (suite) Somme des points de chaque test  5 scores ≡ 5 catégories de performances : - saut (1+2+3) - suite au pied (4+5) - rapport (6+7+8) - attaque ( ) - défense/garde ( )

9 2.B. Matériels (suite) 3 catégories générales :
- Obéissance ( ) - Mordant ( ) - Succès global (19 points)

10 3. Méthodes Aucun groupe ne suit une distribution normale
Normalisation par application de la méthode de Langlois basée elle-même sur « les taux de performances »  Sij : score du chien i dans la compétition j (obtenu par tables statistiques)  Pij : performance du chien i dans une compétition j Pij = Sij + Ej Ej : moyenne des performances du chien obtenues dans toutes les compétitions auxquelles il a participé

11 3. Méthodes Modèle utilisé pour obtenir une distribution normale :
Sij = di – cj + eij di : effet du chien i (fixe) cj : effet de la compétition j (fixe) eij : variable résiduelle Utilisation du programme NAG (NAGL®)

12 Modèle-animal Facteurs d’influence : - sexe (2 classes)
- âge (15 classes) - niveau de difficulté (5 classes) - variété intra-raciale (3 classes) Effets permanents d’environnement : - effets familiaux (mère, père, éleveur) - effets d’entrainement (dresseur)

13 Modèle-animal(suite)
yijklm = µ + niveau âgej + sexek + variété de racel + am + em + εijklm yijklm: score mesurant la performance du chien (m classes) participant à la compétition (i classes) µ : moyenne générale niveau âgej : effet fixe de la combinaison (j classes) entre l’âge et le niveau de compétition sexek : effet fixe du sexe (k classes) variété de racel : effet fixe de la variété de race (l classes) am : variable génétique du chien (m classes) em : variable de l’environnement permanent du chien (m classes) εijklm : variable résiduelle

14 Modèle-animal(suite)
Estimation des effets du modèle : méthode BLUE (best linear unbiased estimation), programme PEST Composants de la variance (variance génétique additive, variance de l’environnement permanent et variance résiduelle) : méthode REML (restricted max likelihood method), programme VCE

15 4. Résultats A. Répétabilité et hérétabilité
r = corrélation entre les différentes mesures individuelles des performances du chien élevé et homogène pour les 8 capacités(0,39 – 0,59) grande influence des effets de l’environnement permanent (importance des conditions de vie sur les performances) h² : valeurs faibles (0,13-0,18 ; suite et succès global : 0,07)

16 4. Résultats(suite)

17 4. Résultats(suite) B. Corrélation génétique et phénotypique
Corrélations phénotypiques faibles sauf pour attaque et défense Corrélations génétiques entre capacités relativement élevées (sauf pour le saut  indépendant des autres)

18 4. Résultats (suite)

19 4. Résultats(suite) C. Effets des facteurs environnementaux
Sexe : mâles > femelles (saut, attaque, défense efforts physiques, instinct de combat) Variété de race : Malinois > Groenendael, Tervueren Age : effet = maturité physique + expérience niveau de difficultés 1  meilleur succès global : 1,6 ans 2  1,6 – 2 ans 3  2,1 – 2,5 ans 4 et 5 3,1 – 4 ans diminution des performances après 7 ans

20 5. Commentaires Forte influence des facteurs d’environnement
Compétition de défense = référence pour l’obtention de données terrains standardisés progression stricte à travers les tests supervisation de chaque intervention par un homme pénalités clairement définies pour chaque faute possible essais de contrôle des effets de l’environnement

21 5. Commentaires (suite) Faible nombre de compétitions et de résultats car difficulté de travailler avec de grands nombres d’animaux en compétition canine Héritabilité estimée faible : 0,07-0,18 raisons: - difficulté de corriger les facteurs d’environnement - sélection génétique depuis le siècle dernier a réduit la variabilité génétique mais suffisante pour entamer un programme de sélection Utilisation de valeurs d’élevage pour réaliser les croisements  plus précis par rapport au système actuel (performances)

22 5. Commentaires (suite) Recherche de qualités spécifiques, chez les chiens de défense, ayant une héritabilité supérieure à celles des capacités générales du Berger Allemand Impossible d’étudier chaque qualité spécifique dans une compétition de défense Suggestions sur le système de notation en compétition: - plus d’indépendance entre la note du chien et le comportement du propriétaire - utilisation de toute la tranche de note (0 à 10) - augmentation du niveau de difficulté de certains tests trop faciles

23 6. Discussion-critiques
Nombre d’animaux utilisés insuffisants Disproportion intra-raciale et du ratio ♂/♀ pas de précision quant à la répartition dans les différents groupes Période d’étude non homogène Détermination des catégories de performances ? (tests non pris en compte, recoupement entre catégories) Nécessité de standardiser les conditions de compétition

24 7. Usages pratiques de ces résultats
Application dans un programme de sélection sélection sur base des compétitions de défense h² faible  amélioration de l’environnement Proposition de standardisation des méthodes d’évaluation des performances

25 8. Bibliographie Courreau J.-F., Langlois B., Genetic parameters and environmental effects which characterise the defence ability of the Belgian shepherd dog, Applied Animal Behaviour Science 91, 2005, p cours de génétique 1er doctorat , Detilleux J., Leroy P.

26 Merci de votre attention!