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Introduction à lenzymologie Des rappels, encore des rappels…??

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1 Introduction à lenzymologie Des rappels, encore des rappels…??

2 Définition dune enzyme : Biomolécule de nature protéique ayant un pouvoir catalytique élevé et douée de spécificité. Protéines globulaires de poids moléculaire élevé. Existence de protéines enzymatiques de structures tertiaires,tertiaires Dautres de structures quaternaires.quaternaires Dans tous les cas grande importance de la structure spatiale Native (notion de site actif).

3 Définition dune enzyme : Biomolécule de nature protéique ayant un pouvoir catalytique élevé et douée de spécificité. 3 effets des catalyseurs: Augmente la vitesse des réactions thermodynamiquement possibles Activité à faible dose Intact en fin de réaction

4 Définition dune enzyme : Biomolécule de nature protéique ayant un pouvoir catalytique élevé et douée de spécificité. Spécificité réactionnelle : chaque enzyme ne catalyse quune seule réaction (ou un groupe de réactions du même type). Spécificité de substrat : « reconnaissance » du substrat par larchitecture spatiale de lenzyme.

5 Notion de site actif :

6

7 2°partie: Notion de bioénergétique : pourquoi une réaction est-elle possible ? Comment agit lenzyme ? G = E - T S Variation dénergie libre Variation dénergie interne température Variation dentropie

8 2°partie: Notion de bioénergétique : pourquoi une réaction est-elle possible ? Comment agit lenzyme ? G = H - T S Variation denthalpie Variation dénergie sous forme de chaleur à pression constante

9 2°partie: Notion de bioénergétique : pourquoi une réaction est-elle possible ? Comment agit lenzyme ? Soit une réaction enzymatique : SP Mesure de la variation denthalpie : H = H P - H S Si H P > H S, alors H > 0 La réaction nécessite de la chaleur Réaction ENDOTHERMIQUE

10 2°partie: Notion de bioénergétique : pourquoi une réaction est-elle possible ? Comment agit lenzyme ? Soit une réaction enzymatique : SP Mesure de la variation denthalpie : H = H P - H S Si H P < H S, alors H < 0 La réaction libère de la chaleur Réaction EXOTHERMIQUE

11 2°partie: Notion de bioénergétique : pourquoi une réaction est-elle possible ? Comment agit lenzyme ? Soit une réaction enzymatique : SP Mesure de la variation denthalpie : H = H P - H S Si H P = H S, alors H =0 La réaction en équilibre Réaction ATHERMIQUE

12 2°partie: Notion de bioénergétique : pourquoi une réaction est-elle possible ? Comment agit lenzyme ? Soit une réaction enzymatique : SP En Biochimie on mesure de la variation dénergie libre : G = G P - G S G > 0 : Réaction ENERGONIQUE G < 0 : Réaction EXERGONIQUE G = 0 : Réaction à lEQUILIBRE

13 2°partie: Notion de bioénergétique : DG et constante déquilibre dune réaction G = G° + R T Ln Keq Variation dénergie libre standard (25°C;1atm;[]=1M) température Constante des Gaz parfaits Keq = k1/k2 = [C][D]/[A][B] A + B C + D k1 k2

14 2°partie: Notion de bioénergétique : DG et constante déquilibre dune réaction G = G° + R T Ln Keq A + B C + D k1 k2 À léquilibre la réaction devient

15 2°partie: Notion de bioénergétique : G et constante déquilibre dune réaction A léquilibre G = 0 alors G° = - R T Ln Keq A + B C + D k1 k2

16 2°partie: Notion de bioénergétique : Catalyse et énergie dactivation La réaction passe par un état de transition S* qui possède une Énergie intrinsèque plus élevée que celle de S ou de P SP

17 2°partie: Notion de bioénergétique : Catalyse et énergie dactivation

18 V = k. [S] = A [S] e - Ea RT k = A. e - Ea RT La vitesse augmente si k augmente. k quand Ea Les enzymes accélèrent les réactions en abaissant lénergie dactivation

19 2°partie: Notion de bioénergétique : Schéma tableau variation énergétique avec catalyseur chimique, Sans catalyseur et avec catalyseur enzymatique. Sauter une rivière….

20 Enzyme de nature tertiaire

21 Enzyme de nature quaternaire


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