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Etude de la variation génétique du cheval polonais Bilgoraj Aubry Laure2 e doctorat Baudry Emmanuelle Paraclinique de Génétique Quantitative.

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1 Etude de la variation génétique du cheval polonais Bilgoraj Aubry Laure2 e doctorat Baudry Emmanuelle Paraclinique de Génétique Quantitative

2 La variabilité génétique des Bilgoraj est évaluée sur les loci de 12 microsatellites et comparée à un groupe de chevaux Thouroughbred polonais et de Malopolski Objectifs

3 Tarpan Malopolski Thouroughbred

4 Matériels PCR à partir échantillons de sangéchantillons de sang Electrophorèse Séquenceur ADN automatisé Détermination taille fragments ADN (Genescan2.1) Génotype (Genotyper 2.0)

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6 Méthodes Données génétiques moléculaires Hardy-Weinberg (test chi carré) Distribution fréquences alléliques = mise en évidence dun goulot génétique? Test de F (Ho He) = Consanguinité ? F st, F is = état déquilibre génétique de ces populations Distance génétique = différences génétiques entre les groupes de Cv

7 Résultats obtenus et discussion Diversité allélique comparée à la littérature Pourquoi? –Petite taille des échantillons –Parenté entre les individus des population B et M –Cv T ont nombre restreint dancêtres fondateurs –Cv B ont probabilité daccouplements consanguins Poney Asturcon et Czech warm blood horses

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9 Différences substantielles dans le pool génétique : races primitives/modernes Allèles communs à M et T Interprétation du tableau

10 Interprétation statistique Equilibre Hardy-Weinberg pour toutes les populations Fréquences alléliques et génotypiques restent constantes au cours des générations

11 Moyenne des F is non significative = pas de variation génétique F st typiques des populations isolées Rappel : F is = (Hs – Hi)/Hs et Fst = (Ht-Hs)/Ht * Hs = 2pq = frqce des Hétérozygotes sous HW * Hi = f(Aa) = frqce des Hétérozygotes dans la population consanguine * Ht = frqce des Hétérozygotes dans population totale

12 Pas de récent goulot génétique Rappel : Effet « goulot » (bottleneck) = diminution de la taille de population Distance génétique : les Cv Bilgoraj ont préservé une grande part de leur propre pool génétique

13 Conclusion Pas de perte substantielle de variabilité génétique dans la population des Bilgoraj Leur pool génétique est limité au niveau des microsatellites = consanguinité inévitable dans si petite population

14 Applications pratiques des résultats par un vétérinaire Bilgoraj risque dextinction? Quand une population subit une de son effectif et un déclin de variation, les allèles rares tendent à disparaître du pool génétique He < Ho Espèces en voie de disparition Exple : poney Asturcon

15 Mécanisme de lextinction = Vortex dextinction de Ne F H drift taux de reproduction de N EXTINCTION

16 Règle : –Ne > 50 pour prévenir la consanguinité –Ne > 500 pour assurer une viabilité à long terme Comment Ne ? - éviter les accouplements consanguins - faire contribuer tous les individus à la génération suivante

17 Possibilités daction? Espèces en voie dextinction : programme de conservation gestion possible de lespèce dans une zone géographique restreinte contrôle de lélevage

18 Questions fondamentales a se poser pour un programme de sauvegarde… Quelles races sélectionner pour la conservation ? Combien dindividus par race choisir ? Doit on croiser différentes races pour sauver lespèce ?

19 Il faut aussi se baser sur dautres facteurs que la génétique brute pour les programmes de sauvegarde: Ethologie de lespèce Biologie de lespèce Distribution des sexes Âge des individus

20 Bibliographie Zabeck T., Nogaj A., Radko A., Nojaj J., Slota E. Genetic variation of Polish endangered Bilgoraj horses and two common horse breeds in microsatellite loci. J. Appl. Genet., 2005, 46 : 3, Detilleux J., Génétique des populations, 2003, Detilleux J., Génétique quantitative, 2003, 1-62 Georges M., Modern genetics for veterinarians and the animal sciences, 2003 Animal genetic resources information, FAO, 2005, 36, 1-119


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