Méningites bactériennes aiguës communautaires Examens microbiologiques

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1 Méningites bactériennes aiguës communautaires Examens microbiologiques
Prélèvements LCR, hémoculture, serum, urine, biopsie cutanée LCR Ponction lombaire aseptique : 3 tubes (0.5-1 ml/tube) Renseignements cliniques, transport sans délai au labo à l’abri du froid Aspect :  purulent, trouble : méningite bactérienne  clair : méningite au début, virus, Listeria, BK, abcès cérébral Chimie : protéines (< 0.4 g/l), glucose (LCR/sang > 60%) Examen direct : Numération leucocytes, May-Grunwald-Giemsa (MGG), Gram

2 Examen direct Numération des leucocytes (< 5/mm3, méningite >1000/mm3) Cytospin centrifugation : colorations MGG et Gram MGG : Formule leucocytaire  >50% neutrophiles : méningite bactérienne (entérovirus)  >50% lymphocytes : virus, Listeria, BK  50% neutro/50% lympho : début, traitement, Listeria, abcès Gram : Spécificité ~ 100% Sensibilité 54-78% (sans traitement). Seuil : 105 UFC/ml  cocci Gram+ : pneumocoque (strepto B, strepto A)  cocci Gram– : méningocoque  bacille Gram– : Haemophilus (E. coli)  bacille Gram+ : Listeria

3 LCR, Aspect trouble clair Eléments nucléés/mm3 > 10 500 - >1000
Type d’éléments > 50% poly.neutro. lymphocytes 50% polyneutro. 50% lympho. Protéines > 0.4 g/l < 0.4 g/l Glucose LCR/sang < 40% (sauf virus) > 60% Orientation Méningite bactérienne (entérovirus) Virus (gluc~) Listeria (gluc↓) BK (chlor↓) Début méningite Listeria Abcès cérébral REMIC

4 Antigènes solubles  Antibiothérapie (et PL de contrôle)
 Examen direct positif (MGG ± Gram)  Antibiothérapie (et PL de contrôle) LCR, urine, serum Pneumocoque : test immunochromatographique Binax Now® (polysaccharide C) Spécificité et Sensibilité ~ 100% Méningocoque : polyosides capsulaires → sérogroupes Latex agglutinants (Test immunochromatographique) sensibilité : 37% → 74% (ultrasons) spécificité : réactions croisées +++ (groupe B / E. coli K1) Latex : Haemophilus influenzae : rare (sérotype b : 15%) Streptocoque groupe B et E. coli K1 (enfant < 12 mois)

5 Cultures - PCR Cultures Géloses au sang, chocolat, 37°C, 5-10% CO2
Observation quotidienne pendant 5 jours Antibiogramme si Direct (Gram) + / CMI (cocci Gram+ et Binax®+) (conserver 0.5 ml de LCR → PCR si culture négative en 24h) Hémoculture (40 - >70%) PCR - PCR enterovirus - PCR spécifiques: méningocoque, pneumocoque Haemophilus, Listeria PCR Méningocoque (espèce et groupes, LCR et serum) (gène crgA : sensibilité 90%, spécificité 93%) - PCR en temps réel (quantification) - PCR universelle (gène ARNr 16S) sensibilité 59%, spécificité 97%

6 Positivité Méningocoque Pneumocoque Gram+ LCR 68% 93% Culture+ LCR 73% 95% Hémoculture+ 41% 77% 1879 méningites Culture LCR négative PCR+ Ag+ Hémo+/LCR>10 élts Gram+ 1170 312 (27%) 130 (41%) 69 (22%) 65 (21%) 22 (7%) 709 46 (6.5%) 11 (24%) 24 (52%) 8 (17%) 3 (6.5%) ACTIV

7 Strepto B E. coli H. influenzae 30 15
Positivité Strepto B E. coli H. influenzae Gram+LCR 88% 85% 73% Culture+LCR 93% 92% 100% Hémoculture+ 81% 77% Méningites LCR culture nég PCR+ Ag+ Hém+/LCR>10él. Gram+ 347 30 3 17 7 2 147 15 / 9 1 70 ACTIV

8 1er jour : LCR (3 tubes)

9 (PCR ciblées / universelle)
2ème jour : Cultures Culture négative LCR conservé → PCR (PCR ciblées / universelle)

10 Conclusion Méningites à culture négative ( 30%) 2008
 fragilité bactérienne (méningocoque)  délai de transport  traitement antibiotique précoce  PCR (spécificité et sensibilité +++) 2008 Nombreux moyens à combiner pour le diagnostic La culture reste la référence