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VARIABILITE GENETIQUE. la variabilité intra-population la variabilité inter-populations.

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1 VARIABILITE GENETIQUE

2 la variabilité intra-population la variabilité inter-populations

3 VARIABILITE GENETIQUE INTRAPOPULATION

4 Paramètres détude de la variabilité intra population : Richesse allèlique Fréquences allèliques Indices de diversité -Taux dhétérozygotie observé -Taux dhétérozygotie théorique -Taux dhétérozygotie non biaisé

5 I- Richesse allélique A=4 1 locus ayant 4 formes alléliques Nombre individu=12 Ne tient pas compte de labondance Un allèle rare a le même poids quun allèle commun - Pour un locus donné : Sensible à la taille de léchantillon - Si plusieurs loci : Nombre dallèles différents présents dans une population Nombre moyen dallèle par locus

6 Tableau : Nombre dallèles pour le microsatellite OarCP34 présents chez les 6 races ovines étudiées. OrigineRaces Nombre total dallèles Algérie Hamra4 Ouled Djellal6 Taâdmit5 Rembi5 Sidaoun4 Dmen algérienne3

7 II-Estimation des fréquences alléliques les fréquences alléliques sont calculés à partir des génotypes des individus étudiés dans une population Les fréquences alléliques sont calculées par le logiciel GENETIX 4.03 (Belkhir et al. 2002) 2 x nbr danimaux homoz pr lallèle i + nbr danimaux hétéroz pr lallèle i Pi= 2N N : nombre total danimaux typés au locus K

8 Exemple du groupe sanguin MN chez l'homme Lexamen de 730 aborigènes australiens a donné les résultats suivants Groupe sanguinGénotypeNombreFréquence [M]MM [MN]MN [N]NN

9 Les fréquences alléliques calculées sont les suivantes:

10 Tableau : Fréquences alléliques pour le microsatellite OarCP34 chez les 6 races ovines étudiées Fréquences alléliques en % OrigineRaces Allèles en pb Algérie Hamra Ouled Djellal Taâdmit Rembi Sidaoun Dmen algérienne

11 Figure : Histogramme des fréquences alléliques pour le microsatellite OarCP34 dans les 13 races ovines étudiées.

12 III- Indices de diversité Taux dhétérozygotie observé Taux dhétérozygotie théorique Taux dhétérozygotie non biaisé

13 Taux dhétérozygotie théorique une valeur théorique qui correspond à lhétérozygotie de la population, en la supposant à lEHW. 1k Hth=1- P 2 ikx i =1 PiKx est la fréquence de lallèle i au locus k dans la population x.

14 Taux dhétérozygotie observé le rapport du nombre danimaux hétérozygotes sur le nombre total danimaux typés pour un locus.

15 Taux dhétérozygotie non biaisé Utilisé lorsque le nombre danimaux testés est faible. Formule logiciel GENETIX 4.03 (Belkhir et al. 2002).

16 En raison du faible nombre danimaux typés, pour le microsatellite OarCP34 (13 à 30 ADN), nous tiendrons compte des valeurs des taux dhétérozygotie non biaisés OrigineRaces Nbr déchantillons HthHobsHnb Algérie Hamra Ouled Djellal Taâdmit Rembi Sidaoun Dmen algérienne


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